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编号:2294175
TRIM31与慢性肝病的孟德尔随机化及生物信息学分析
http://www.100md.com 2025年4月4日 医学新知 2025年第3期
    

    【摘要】目的" 使用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析评估肝脏TRIM31表达水平与慢性肝病的因果关系,以及生物信息学方法分析TRIM31在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的作用。方法" 利用FinnGen R10数据库中非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)、肝纤维化、肝硬化、HCC的遗传数据,以及GTEx Portal肝组织cis-eQTL数据中与TRIM31表达显著相关的单核苷酸多态性作为工具变量,采用逆方差加权法作为主要方法进行MR分析。使用TCGA分析TRIM31在HCC中的表达,并利用CIBERSORT算法分析TRIM31表达与免疫细胞浸润的相关性,ROC曲线评估诊断准确性。使用TCGA数据库进行高和低TRIM31表达组之间的差异基因表达分析,并进行GO富集、KEGG通路富集和基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)。结果" MR分析结果显示,肝脏TRIM31表达与NAFLD[OR=0.98,95%CI(0.91,1.05),P=0.515]、NASH[OR=0.98 ......

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