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基于网络药理学探讨鹿茸对肾细胞癌的作用机理(2)
http://www.100md.com 2019年9月1日 《中国保健营养》 201909
     3.4靶点相互作用网络图的构建与分析

    将鹿茸靶点与肾细胞癌靶点关联分析获得的20个相交靶点导入到STRING数据库中,获取蛋白质相互作用关系,并得出各靶点间相互作用的网络图,结果如图1所示。其中“节点”代表作用靶点,“边”代表各靶点之间的相互关联,其“粗细”用“combine score” 表示,边越粗,combine score值越大,代表其结合度越大。由图可知,共有20个节点、83条边,平均节点度为8.3,平均局部聚类系数为0.744。

    3.5 GO生物过程富集

    利用 David 6.8数据库将鹿茸作用于肾细胞癌的20个靶点进行 GO 分析,从生物学过程、细胞组成、分子功能对20个关键靶点进行分类分析,分别得到170、16、33条,P<0. 05 者分别为143、13、26 条。其中生物学过程包括药物反应、一氧化氮生物合成的正调节、RNA聚合酶II启动子转录的正调节、RNA聚合酶II启动子转录的负调节;细胞组成包括等离子体膜、细胞表面、蛋白质复合体、细胞外区域等;分子功能包括酶结合、类固醇激素受体的活动、类固醇结合、相同的蛋白结合等。

    3.6 KEGG 信号通路分析

    利用 David 数据库进行KEGG信号通路富集 ......
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