摘要：目的 采用Illumina HiSeq 4000测序技术获得三葉青转录组数据，为三叶青分子生物学研究提供重要分子信息。方法 以三叶青根和茎叶为材料，进行转录组测序，对测试数据进行基因功能注释、代谢途径及微卫星等的生物信息学分析。结果 共获得24.13 Gb Clean Data，拼接组装得到84 433条Unigene，与7个基因数据库进行比对，最终获得47 766个有注释信息的Unigene。在GO数据库中注释27 790条，其根和茎叶的差异表达基因数目为4989个，其中上调为3511个，下调为1478个；COG数据库得到16 152条三叶青Unigene的同源序列，共分为25个类别；在KEGG数据库有14 511条Unigene获得对应的Ko编号，可分为130个信号代谢分支 ......