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编号:375024
左金丸抗幽门螺杆菌感染的分子网络调控机制研究
http://www.100md.com 2020年5月16日 中国中医药信息杂志 2020年第5期
吴茱萸,黄连,1方法,1左金丸化学成分筛选,2左金丸作用靶点预测和成分-靶点网络构建,3幽门螺杆菌相关疾病靶点检索,4左金丸抗幽门螺杆菌蛋白相互作用网络构建,5GO功能富集分析,6KEGG通路富集分析,7左金丸抗幽
     陈新怡,曾梅艳,宋厚盼,陈小娟,林也,蔡雄,喻嵘,彭清华

    左金丸抗幽门螺杆菌感染的分子网络调控机制研究

    陈新怡1,2,曾梅艳2,宋厚盼1,2,陈小娟1,2,林也1,2,蔡雄1,喻嵘2,彭清华1

    1.湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室,湖南 长沙 410208;2.湖南中医药大学中医学院,湖南 长沙 410208

    基于网络药理学和生物信息学方法探究左金丸抗幽门螺杆菌(Hp)感染的分子网络调控机制。通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索左金丸化学成分,筛选并预测其入血活性成分和作用靶点,检索疾病数据库中与Hp感染相关的作用靶点,构建左金丸成分靶点与疾病靶点的交互网络,获得左金丸抗Hp的特征性基因;通过DAVID6.8数据库对上述特征性基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;利用Cytohubba筛选出左金丸抗Hp感染的关键靶点。通过TCMSP筛选、预测得到左金丸32个入血活性成分和197个作用靶点。GO分析共得到199条富集结果,其中生物过程包含炎症反应、RNA信号转录、信号传导等152条,细胞组分包含细胞核、细胞外基质、蛋白复合物等19条,分子功能包含细胞因子活性、DNA结合、ATP结合等28条。KEGG分析结果显示,Jak-STAT信号通路、T细胞受体信号通路、细胞周期信号通路、Wnt信号通路等65条通路与左金丸抗Hp感染密切相关。经Cytohubba筛选得到CXCL8、IL10、IL4、VEGFA、MMP9等10个关键基因。左金丸抗Hp感染具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点,可为其活性成分研究和抗Hp药效及机制研究提供依据。

    左金丸;幽门螺杆菌;网络药理学;分子机制;信号通路

    幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)是一种微需氧型革兰阴性细菌,是目前已知的唯一一种生长于人类胃部的细菌[1]。流行病学研究表明,我国自然人群Hp总感染率为56.22%,其中广东地区Hp感染率最低(42.01%),西藏地区Hp感染率最高(84.62%)[2]。Hp感染已被证实与慢性胃炎、消化性溃疡、胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤、胃癌等多种胃肠疾病的发生发展密切相关,并可通过饮食在人与人之间传播[3]。目前,抗Hp感染是防治多种消化性系统疾病的重要指征和有效途径,方案首选铋剂四联疗法。但四联疗法存在靶向性单一、不良反应大、患者个体差异大(依从性差)等缺点,Hp对抗生素的耐药性增高已成为Hp根除率下降及根除失败的主要原因[4]。此外,我国作为Hp感染率较高的国家,有研究表明,Hp对克拉霉素和甲硝唑等抗生素的原发耐药率和多重耐药率逐年上升[5] ......

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