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编号:374967
基于生物信息学的疏肝利胆和胃方组方特点及治疗反流性食管炎机制分析
http://www.100md.com 2020年8月14日 中国中医药信息杂志 2020年第7期
半夏,1资料与方法,1疏肝利胆和胃方相关数据集采集与处理,2疏肝利胆和胃方药物聚类描述,3反流性食管炎背景网络构建,4疏肝利胆和胃方治疗反流性食管炎潜在靶点及功能富集,2结果,1疏肝利胆和胃方主
     彭艳红,吴东宁,滕丹,白光,王庆峰

    1.辽宁中医药大学附属医院,辽宁 沈阳 110032;2.北京丰台右安门医院,北京 100069;3.辽宁何氏医学院,辽宁 沈阳 110163;4.辽宁中医药大学中西医结合学院,辽宁 沈阳 110032

    反流性食管炎(reflux esophagitis,RE)是消化内科常见疾病,为胃及十二指肠内容物反流入食管,最终引起的食管炎症性病变[1]。RE 可发生于任何年龄人群,成人发病率随年龄增长而升高。其发病机制有反流屏障受损、反流物侵蚀作用、胃排空障碍、幽门螺杆菌感染,以及炎症介导因子等。RE 中医病机可概括为肝胆失于疏泄,胃失和降,导致胃气上逆,上犯食管,其临床常见证型为肝胃不和[2]。疏肝利胆和胃方由半夏、黄芩、柴胡、枳实、蒲公英、砂仁、浙贝母、白及、白芷、茯苓组成,乃国医大师周学文所创,宗半夏泻心汤、小柴胡汤、四逆散、参苓白术散、乌贝散之义,辛苦同进,升降并用,补泻兼施,共奏疏肝理气、健脾和胃、降逆止呕之功。但其作用机制尚不明确。

    目前,中药复方作用机制分析已由单一靶点或信号通路过渡到以网络药理学为代表的系统生物学和多向药理学研究[3]。通过生物信息学手段,可对复方的物质基础及作用分子靶点进行网络融合,并进一步应用数据库工具探索复方的起效机制。然而,网络药理学研究大多通过分析多成分-多靶点网络作用关系探讨复方的整体作用[4-5],虽然符合中医的整体观念及辨证论治特性,但对复方中重要药对的配伍关系分析不足。因此,如何应用现有技术对复方内的药物组成关系进行深入研究,并进一步考察组方的配伍关系,是网络药理学处理复杂复方的难题之一。为此,本研究除采用网络药理学方法对疏肝利胆和胃方进行数据挖掘外,应用主坐标分析(principal coordinate analysis,PCoA)考察方中药味之间的相互关系,并进一步分析复方作用的核心分子靶点,预测疏肝利胆和胃方治疗RE 的物质基础及机制,以期为同类研究提供方法学参考。

    1 资料与方法

    1.1 疏肝利胆和胃方相关数据集采集与处理

    通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,http://lsp.nwsuaf.edu.cn/tcmsp.php)检索疏肝利胆和胃方中各药物的化学成分及对应分子靶点。遵照Lipinski 规则对所获得的化学成分进行筛选,筛选条件[6]:①分子量(MW)<500;②脂水分配系数(Alog P)≤5;③氢键供体数目(Hdon)≤5;④氢键受体数目(Hacc)≤10 ......

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