基于网络药理学的左金丸治疗肝癌机制探讨
吴茱萸,1资料与方法,1左金丸化合物与靶点获取,2肝癌疾病基因获取,3活性成分-靶点,疾病-中药-化合物-交集靶点(基因)网络构建,4蛋白相互作用网络构建,5GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,6成分-靶点-通路网络
莫嘉浩,许洪彬,李菁,李金生,綦向军,钟崇基于网络药理学的左金丸治疗肝癌机制探讨
莫嘉浩1,许洪彬1,李菁2,李金生3,綦向军4,钟崇5
1.广州中医药大学第二临床医学院,广东 广州 510405;2.湖南中医药大学第一附属医院,湖南 长沙 410007;3.广州中医药大学第三临床医学院,广东 广州 510405;4.广州中医药大学第一临床医学院,广东 广州 510405;5.广州中医药大学第一附属医院,广东 广州 510405
运用网络药理学研究左金丸治疗原发性肝癌的作用机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取左金丸的化合物及靶点,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为阈值进行化合物筛选,将靶点输入Uniprot获取靶点对应的基因Symbol;从人类基因数据库(GeneCards:The Human Gene Database)获取原发性肝癌的疾病基因,并筛选出与左金丸靶点基因的交集基因;运用Cytoscape3.7.1软件绘制活性成分-靶点、疾病-中药-化合物-交集靶点(基因)网络图;运用String构建蛋白相互作用网络,运用g:Profiler数据分析平台进行GO富集及KEGG通路富集分析;联合主要化合物、交集基因与通路分析结果,绘制成分-靶点-通路网络图。筛选得到左金丸化合物41种、交集基因111个,剔除不含交集基因(靶点)的化学成分后得到化合物31种,槲皮素、黄连素、吴茱萸碱等为左金丸的主要活性成分,AKT1、TP53、HSP90AA1等为主要作用靶点。GO富集分析共获得条目136条,涉及细胞因子受体结合、核受体结合、调控序列特异性DNA结合等多个生物过程,KEGG富集分析得到165条通路。左金丸通过多靶点调控PI3K-Akt信号通路、乙型肝炎通路、IL-17信号通路等治疗原发性肝癌。经生物信息学的基因芯片验证,结果基本相符。
左金丸;原发性肝癌;网络药理学;信号通路
原发性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)指发生于肝细胞或肝内胆管细胞的恶性肿瘤[1],全球病死率居恶性肿瘤第三位[2]。2015年报道,我国肝癌发病率为466.1/10万,病死率为422.1/10万[3]。因其具有发病隐匿、进展迅速、复发快、预后差等特点[4],故防治是临床研究重点。
左金丸出自《丹溪心法》,由黄连、吴茱萸组成,主要用于肝火犯胃之呕吐、胁痛等。药理学研究表明,其水煎液可通过阻断AP-1等通路有效抑制肝癌细胞HepG2的增殖 ......
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