郑飘，陈博威，宁迪敏，肖唯，田雪飞

    大柴胡汤治疗肝细胞癌lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

    郑飘1，陈博威2，宁迪敏1，肖唯3，田雪飞1

    1.湖南中医药大学中西医结合学院，湖南 长沙 410208；2.湖南中医药大学第一附属医院，湖南 长沙 410007；3.中南大学湘雅医院中西医结合研究所，湖南 长沙 410008

    挖掘大柴胡汤治疗肝细胞癌的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络，探讨其抗肝癌作用机制。利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GEO、miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库获取大柴胡汤的活性成分、预测靶点及肝细胞癌的差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)、微小RNA(miRNAs)和mRNAs，通过R语言和Perl软件筛选大柴胡汤治疗肝细胞癌的关键lncRNAs、miRNAs、mRNAs。采用Cytoscape3.7.0软件和STRING数据库构建活性成分-靶点网络、lncRNA-miRNA-mRNA转录网络和蛋白相互作用网络，进行GO和KEGG富集分析，并予分子对接验证，进行整合分析。得到大柴胡汤治疗肝细胞癌的97个有效成分和42个靶点，构建了由19个关键lncRNAs、23个关键miRNAs和42个关键mRNAs组成的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络。富集分析结果显示，这些靶基因参与了肿瘤的生存、凋亡、自噬、氧化应激、蛋白激酶等生物学过程，主要通过PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和TNF信号通路等发挥作用。大柴胡汤治疗肝细胞癌具有多成分、多靶点、多途径协同作用特点，可为相关研究提供依据和方向。

    肝细胞癌；大柴胡汤；转录网络；生物信息学；网络药理学；分子对接

    肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是原发性肝癌最主要的组织学亚型，具有侵袭和转移率高、复发风险高、中晚期并发症严重等特点。目前，其临床首选方法为手术、放疗和化疗。尽管靶向药物的新发展为肝癌治疗带来希望，但价格昂贵、反应率低、耐药性频繁，导致其临床应用局限。大柴胡汤出自《伤寒论》，由柴胡、大黄、枳实、黄芩、半夏、白芍、大枣和生姜组成，有疏肝理气之功。临床研究表明，大柴胡汤对HCC表现出良好疗效，可增强HCC患者机体免疫力，减少并发症的发生发展[1-2]。实验研究显示，大柴胡汤可促进肝癌HepG2细胞凋亡、抑制肝纤维化和调节代谢等[3-5]。然而，以往研究主要集中于单一靶点和单一机制，未能基于中医整体观念系统探讨大柴胡汤治疗HCC的分子机制 ......