基于网络药理学探讨肝积方治疗肝细胞癌作用机制
靶点,肝癌,通路,1材料与方法,1肝积方主要化学成分收集和筛选,2主要作用靶点收集和筛选,3疾病靶点收集,4靶点生物功能富集分析,5实验验证,2结果,1肝积方有效化学成分,2肝积方有效成分作用靶点及肝癌疾病靶点,3
王珏,张春蕾,杨铭,杨悦,郑培永,宋海燕1.上海中医药大学附属龙华医院脾胃病研究所,上海 200032;2.上海中医药大学附属龙华医院,上海 200032;3.上海中医药大学附属龙华医院国家药物临床试验机构办公室,上海200032
原发性肝癌最常见的类型为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC),约占75%~85%[1]。2018年全球新发肝癌病例中,约46.7%在我国[2]。虽然近年来关于HCC的诊断和治疗有显著进步,但尚未达到控制该病的目的。在我国,中医药在肝癌治疗中发挥了重要作用,尤其是大量晚期肝癌患者。
肝积方以名老中医邱佳信为首的上海中医药大学附属龙华医院肿瘤科组方,临床治疗肝癌效果良好,可单独或联合靶向药抑制肝癌生长和转移、改善患者症状和生存质量。临床试验显示,肝积方单独用于治疗晚期原发性肝癌的患者1年生存率为31%(18/58),而对照组为4.5%(1/22)[3]。动物实验研究显示,肝积方可预防二乙基亚硝胺(DEN)诱发大鼠肝癌的发生[4],可抑制HCC细胞增殖和皮下瘤的生长[5]。然而,肝积方抑制HCC的作用机制尚不明确。因此,本研究采用网络药理学方法,通过筛选肝积方有效成分,根据生物基因组、蛋白质相互作用、疾病和药物靶点等信息,综合评价该复方对HCC的效应,并分析其潜在作用靶点和相关调控机制。进一步通过药物对HCC动物模型的干预实验,探讨肝积方治疗HCC的药效及部分机制。
1 材料与方法
1.1 肝积方主要化学成分收集和筛选
利用TCMSP(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)[6]、HIT(http://hcls.hit.edu.cn/hclsen/main.htm)[7]、TCMID(http://bidd.group/TCMID/)及STITCH(http://stitch.embl.de/)[8]数据库检索太子参、白术、茯苓、岩柏、马兰根、夏枯草、鳖甲、天南星、牡蛎、丹参、八月札,获取相应化学成分,将收集到的化学成分理化特征与已知药物的相同特征按照类药性评估指标(quantitative estimate of druglikeness,QED)[9]评估化合物ADME(吸收、分布、代谢、排泄)性质。QED=,式中di为整合8种主要分子描述符的渴求函数,分别为化合物相对分子质量、油水分配系数、氢键受体数、氢键供体数、分子极性表面积、化合物中可旋转键数、化合物中芳香环数及非药子结构数[10] ......
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