虽然，上述研究充分说明基因芯片检测临床标本预测疗效的可能性，但也有研究并未发现阳性结果，如Cleton-Jansen通过收集25个化疗前的活检标本，包括8个化疗坏死率大于90%和17个化疗坏死率小于90%的标本，在Hu133A GeneChip Arrays中分析并未发现差异表达基因的存在[13]。

    自2002年《Nature》杂志发表成功利用基因表达谱芯片的差异对乳腺癌患者5年内的预后进行预测以来[14]，越来越多的基因芯片经FDA批准用于临床。然而，芯片平台差异及芯片检测结果的重复性尚值得进一步确证。通过上述文献分析，我们看出重复性的结果少于研究结论，这有可能是样本本身、样本量及检测手段的差异造成。基于条件所限，我们仅对5年前文献进行了分析总结，而近年来，基因芯片技术以其标准化的流程、坚实的理论和实验的支持 ......