目前，研究及实践中发现单病种付费有诸多优点，从医疗事业可持续发展角度来说，单病种付费一方面可以有效控制医疗费用的增长，降低患者的医疗费用，缓解政府在医疗保险中的经济负担，并可以充分利用医疗保险基金；由于单病种付费对每一病种的医疗费用进行限高，促使医院主动控制医疗成本，探索合理的临床路径，促进疾病诊疗的标准化和医疗费用的合理化，进一步规范诊疗行为，提高服务质量，以增强医院的竞争力。因此，单病种付费方式实现医疗机构和患者的共赢。在保证医疗质量的前提下，患者的医疗费用得到有效控制，减轻经济负担，提高了就医体验；对医院来说，单病种付费能缩短平均住院日，提高病床周转率，缓解床位紧张。

    当然，单病种付费方式也有一定局限性。①病种范围小。目前，单病种付费主要针对指征明显、诊断明确、技术成熟、治疗流程和效果可控性强的常见病和多发病，一般集中在外科，而对于内科或者综合性疾病患者医疗费用的控制，还有待于进一步探索。②可能会造成医院间的恶性竞争。由于单病种付费中只限定了上限，因此医院为了吸引患者会恶意降低医疗价格，导致医疗质量下降，增加患者住院次数等。③单病种付费方式中难以制定统一价格标准，若价格规定不合理，将偏离医疗服务成本开支的实际情况。由于医院等级、规模、人力资源结构、设备配备水平、所处地区物价水平等因素影响，不同等级、不同规模的医院对同一种疾病的诊疗和成本将会存在差异，因此如何制定合理的成本控制标准 ......