甲状腺癌中miR-222关键靶基因预测及其信号通路分析
1资料与方法
1.1资料来源 从TCGA 数据库(https：//cancergenome.nih.gov/)下载510例甲状腺癌和58例癌旁组织的mRNA-seq数据和miRNA-seq数据，并取Log2将其表达值标准化。从miRWalk(http：//mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/)数据库[7]下载人类miR-222可能的靶基因数据。
1.2方法
1.2.1 miR-222表达 选取miR-222在甲状腺癌及其癌旁组织的表达数据，利用GraphPad Prism7绘制其在癌组织和正常组织的表达图。
1.2.2 miRNA的差异表达 利用计算机R软件中edgeR包筛选出510例癌症组织与58例癌旁组织相比表达下调的基因，筛选条件为：Log2|差异倍数(FC)|, http://www.100md.com(黄琪峰 郑琳琳 张菁)
1.1资料来源 从TCGA 数据库(https：//cancergenome.nih.gov/)下载510例甲状腺癌和58例癌旁组织的mRNA-seq数据和miRNA-seq数据，并取Log2将其表达值标准化。从miRWalk(http：//mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/)数据库[7]下载人类miR-222可能的靶基因数据。
1.2方法
1.2.1 miR-222表达 选取miR-222在甲状腺癌及其癌旁组织的表达数据，利用GraphPad Prism7绘制其在癌组织和正常组织的表达图。
1.2.2 miRNA的差异表达 利用计算机R软件中edgeR包筛选出510例癌症组织与58例癌旁组织相比表达下调的基因，筛选条件为：Log2|差异倍数(FC)|, http://www.100md.com(黄琪峰 郑琳琳 张菁)