垂体瘤的基因芯片数据生物信息学分析(1)
摘要:目的 应用生物信息学技术筛选参与垂体瘤发生发展过程中的关键基因及通路,为垂体瘤治疗提供新靶点。方法 基于基因表达微阵列芯片数据集GSE51618及GSE26966,使用在线分析工具GEO2R筛选差异表达基因,利用GeneOntology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)对差异基因的功能进行富集分析,通过STRING及Cytoscape构建蛋白-蛋白相互作用网络并筛选出关键基因及预测关键转录因子。结果 共筛选到符合条件的差异表达基因354个,其中共同上调基因296个,共同下调基因58个。GO富集分析显示其主要参与细胞表面受体信号通路、细胞增殖等生物学过程 ......
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