罗戈雯，何 杰，张 维

    (成都医学院临床医学院第一附属医院呼吸与危重症医学科，四川 成都 610500)

    特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis，IPF)是一种以成纤维细胞增殖和细胞外基质沉积为病理特征的慢性肺部疾病，对于其发病机制目前没有统一定论[1，2]。IPF 起病较为隐匿，呼吸困难或者肺泡炎是其早期主要表现，患者若出现了肺功能改变和影像学征象变化时，说明已经进展到疾病的中晚期，最终导致治疗效果差，患者生存期短[3，4]。早期诊断和治疗并加以动态评估，对于提高IPF 患者生活质量、延缓病程具有重要的意义[5]。研究报道显示，炎症和免疫效应细胞可以进入肺内并过度释放肺内活性介质，促进细胞外基质沉积和肺成纤维细胞的增殖；同时肺部自噬水平的不足，肺泡上皮细胞产生上皮-间质效应，进一步加重了肺纤维化过程[6-9]。近年来，生物信息技术逐渐运用于呼吸系统疾病的靶基因筛选和机制的研究。因此，本研究通过生物信息分析技术筛选出GSE53845[10]、GSE24206[11]、GSE10667[12]三个IPF 基因芯片数据集中的自噬相关基因，通过检测筛选出的自噬基因在IPF 患者支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid，BALF)和血清中的表达量，分析其与患者肺功能、呼吸困难评分以及肺泡灌洗液中巨噬细胞计数等指标的相关关系，探讨自噬基因在特发性肺纤维化诊断及疾病评估方面的临床价值，为临床治疗提供一定的依据。

    1 材料与方法

    1.1 数据来源 从GEO 数据库(http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中下载基因芯片数据集GSE24206、GSE10667 以及GSE53845。其中GSE24206 包含有IPF 肺组织标本17 个和正常肺组织标本6 个，GSE10667 包含有IPF 肺组织标本31 个和正常肺组织标本15 个，GSE53845 包含有IPF 肺组织标本40个和正常肺组织标本8 个。从人类自噬基因数据库(HADb，http://www.autophagy.lu/)中获取总的自噬相关基因数目222 个。

    1.2 确定差异表达的自噬相关基因 使用R 软件中的limma 包筛选(筛选条件为|logFC|>2；adj.P.Value<0.05)差异表达的基因 ......