基于生物信息学分析的激素性股骨头坏死相关核心基因和通路识别
亚铁,甘氨酸,差异基因,1资料与方法,2结果,3讨论
王 宽,茆 军,张 立,邢润麟,梅 伟,丁 亮,张农山,王培民(1.南京中医药大学第一临床医学院,江苏 南京 210029;2.江苏省中医院骨科,江苏 南京 210029)
激素性股骨头坏死(steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH)是指高剂量激素导致股骨头活性成分死亡的病理过程。SONFH 是非侵袭性坏死最常见的原因之一[1],在没有有效治疗的情况下,80%的患者会在1~3 年内出现股骨头塌陷,且难以逆转[2],大多数患者需要人工关节置换术。SONFH 主要发病人群为中青年,但人工关节置换术的长期效果仍难以预测[3]。因此,SONFH 早期阶段的检测、寻找有效的方法就显得尤为重要。然而现有的SONFH 生物标志物预测价值有限,迫切需要进一步深入研究SONFH 发生发展的分子机制,从而实现SONFH的早发现、早诊断、早治疗,以提高治疗效果,改善患者预后。基因芯片是基于碱基互补配对原则,利用化学的合成等技术,出现的高通量测序方法[4]。研究显示[5],疾病的发生是受特异基因表达量的变化影响,这些基因变化的表达水平与人类正常的表达水平有明显的不同。本研究基于生物信息学提取差异基因,研究其所在通路及参与的生理病理过程,从而发现关键性的致病基因,旨在为SONFH的早期发现和诊断提供方向,预测潜在的SONFH 治疗药物,为SONFH的分子发生机制、临床诊断和药物治疗提供参考。
1 资料与方法
1.1 芯片数据的筛选 截止至2020 年11 月,以“steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,homo sapiens”为关键词从公共基因表达总表(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)搜索目标基因芯片,经过筛选,最终选取GSE123568 作为本次研究的目标数据基因芯片。GSE123568 共有40 个样本,由30例SONFH 患者样本和10例健康样本组成 ......
您现在查看是摘要页,全文长 8315 字符。