基于生物信息学检测NSUN2 基因在胶质瘤中的表达及临床意义
人脑,病理,1资料与方法,2结果,3讨论
张 群,田秋思,唐铖铖,冯 光,路宏朝(1.陕西理工大学生物科学与工程学院,陕西 汉中 723000;2.三二〇一医院神经外科,陕西 汉中 723000)
人脑胶质瘤是中枢神经系统最常见的原发性恶性肿瘤,预后差,其中以多形性胶质瘤(glioblastoma multiforme,GBM)恶性程度最高,患者总生存时间仅10~15 个月[1]。人脑胶质瘤的发病机制非常复杂,具体机制仍不清楚。相关基因表达异常在人脑胶质瘤尤其是NSUN2 的发生、发展中起着至关重要的作用[2]。因此,筛选人脑胶质瘤特异且敏感的差异表达基因有助于认识人脑胶质瘤,同时有利于人脑胶质瘤的早期诊断和精准治疗。5-甲基细胞嘧啶(m5C)通过RNA 代谢调节,特别是RNA 稳定性、RNA 导出RNA、mRNA 翻译和RNA 处理参与肿瘤的发生[3,4]。NOP2/Sun 结构域家族成员2(NSUN2)也被称为MYC 诱导的SUN 结构域含蛋白(Misu),是催化m5C 形成的主要m5C 修饰酶。根据免疫组化学(IHC)分析,NSUN2 在各种肿瘤中均高度表达,包括食管、肝脏、胰腺、子宫颈、肾、胃、甲状腺和乳腺癌[5-8]。研究表明[4],NSUN2 通过与其3'-UTR 中的m5C 修饰位点结合稳定HDGF癌基因的mRNA 来促进膀胱癌的进展。然而,关于NSUN2 在神经胶质瘤中的作用的研究还很少。本研究使用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据集分析NSUN2 基因在正常脑组织与GBM 中的表达差异,以及NSUN2 与GBM 患者临床病理特征的相关性,旨在为深入研究GBM 的靶向治疗提供思路。
1 资料与方法
1.1 数据来源 从TCGA(https:/lcancergenome.nih.gov/)数据库下载GBM 的mRNA 表达谱数据 ......
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