王婷婷，温凌杜，王子弘，李孔亮，古妍琪，杨宏宇

    (1.北京大学深圳医院口腔医学中心，广东 深圳 518000；2.深圳市宝安妇幼保健院口腔科，广东 深圳 518000；3.南方医科大学公卫学院，广东 广州 510000)

    口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma，OSCC)是口腔颌面部最常见的癌症之一，每年影响约超过40 万人[1]。尽管近几十年来诊断和治疗方法不断更新，但由于OSCC 具有高复发率和高颈部淋巴结转移的风险，导致OSCC 的预后并没有明显改善，5 年总生存率仍为45%～50%[2]。因此，有必要进一步阐明OSCC 的发病机制，以挖掘潜在的生物标志物以改善预后。DNA 甲基化是表观遗传修饰的重要表现形式，可影响血管生成、细胞周期的调控或DNA 损伤修复等多个方面[3]，而异常的DNA 甲基化与肿瘤发病机制和癌症患者的生存率显著相关[4]。因此，本研究应用生物信息学方法分析OSCC 样本的DNA 甲基化高通量微阵列信息，并分别进行基因本体论(gene ontology，GO)和京都基因和基因组百科全书(kyotoencyclopedia of genes and genomes，KEGG)通路富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction，PPI) 网络和Cytoscape软件的MCODE 模块分析以及生存分析，以期鉴定出OSCC 差异甲基化区域(differentially Methylated Region，DMR)中与预后相关的关键基因，并初步探究其在OSCC 中的作用机制，现报道如下。

    1 资料和方法

    1.1 数据下载与整理 在GEO 数据库中以“Methylation，450k，OSCC”为检索条件，筛选并下载DNA 甲基化分析数据集GSE87053，平台信息为GPL13534 IlluminaHumanMethylation450 BeadChip (Human-Methylation450_15017482)，共包含21 个样本，其中正常样本10 例，OSCC 样本11 例。

    1.2 数据处理与DMRs 的筛选 应用R 软件(V 3.6.1)minfi、impute、wateRmelon、IlluminaHumanMethylation450kmanifest、IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 和cluster 包对数据行归一化处理及质控 ......