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编号:447922
基于生物信息学分析构建免疫相关基因脓毒症预后模型
http://www.100md.com 2022年9月9日 医学信息 2022年第15期
活化,通路,1资料与方法,2结果,3讨论
     朱思哲,叶成林

    (1.华中科技大学同济医学院附属同济医院临床免疫研究室,湖北 武汉 430030;2.武汉大学人民医院病理科,湖北 武汉 430060)

    脓毒症(sepsis)是宿主对感染的免疫反应失调而导致危及生命的器官功能性障碍[1]。据保守估计,脓毒症是全世界死亡和危重病的主要原因[2]。尽管在过去的几十年中,脓毒症的预后有所改善,但脓毒症休克的死亡率仍高于25%~30%,甚至40%~50%[3]。此外,幸存的脓毒症患者通常要承受长期的身体、心理和认知障碍[4]。脓毒症与其他主要流行病不同,其治疗是非特异性的,没有批准的药物,只能给予维持器官功能、抗生素和保障血液动力学稳定治疗。因此,迫切需要探索更多潜在的脓毒症诊断生物标志物并构建预后模型,从而提高治疗决策的有效性。免疫反应失调在脓毒症中扮演着重要的角色。单核细胞和巨噬细胞是先天免疫系统的主要组成部分,在脓毒症期间协调宿主免疫反应方面发挥着关键作用。在脓毒症的早期阶段,两种不同的淋巴细胞分泌的促炎因子和趋化因子水平升高,这会加剧炎症反应,增加死亡率[5]。中性粒细胞是体循环中最丰富的白细胞。研究表明,脓毒症患者中循环中性粒细胞增加可导致免疫失调,通过释放细胞因子和活性氧导致多器官衰竭,CD4+T 细胞可以直接介导宿主对脓毒症的反应,脓毒症导致的细胞凋亡会诱导CD4+T细胞的耗竭[6]。而脓毒症导致记忆CD8+T 细胞表型、保护功能和定位的长期改变,可能会改变宿主对再感染的反应能力[7]。因此,免疫相关基因在脓毒症的诊断与预后预测方面具有巨大潜力。目前,关于免疫相关基因在脓毒症的诊断与预后方面的研究报道罕见。基于此,本研究通过生物信息学分析获得具有表达差异的免疫相关基因,并探索其生物学功能。进一步通过LASSO 回归和多因素COX 回归分析筛选脓毒症独立预后基因,并构建预后风险模型,以及探索所筛选的基因在脓毒症中的诊断价值,为脓毒症的诊断、治疗和预后提供新的思路。

    1 资料与方法

    1.1 数据来源 通过GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载脓毒症基因芯片表达数据集GSE134347、GSE13904 和GSE65682,每个数据集样本信息见表1。通过CIBERSORTx 数据库(https://cibersortx.stanford.edu/)分析GSE134347 数据集中每个样本中22 种常见免疫细胞的浸润程度 ......

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