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编号:447934
基于生物信息学方法探究溃疡性结肠炎的关键基因和通路
http://www.100md.com 2022年9月26日 医学信息 2022年第16期
细胞骨架,网络图,靶点,1资料与方法,2结果,3讨论
     宋 崟,张科

    (天津医科大学总医院药剂科,天津 300052)

    溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种以结直肠黏膜连续性、弥漫性炎症表现为特点的慢性非特异性疾病,其发病机制尚不明确,临床很难根治。UC 主要症状为腹痛、腹泻、黏液脓血便等,症状轻重不等,但多为反复发作的慢性病程,严重影响患者的心理、经济状况和生活质量[1-3]。目前UC 以药物治疗为主,常用药物有氨基水杨酸类、糖皮质激素、免疫抑制剂等,但这些药物存在一定的不良反应,患者依从性低,治疗效果也不理想[4,5]。因此,寻求新的药物治疗靶点,开发新的高效、低毒的UC 治疗药物成为研究热点。近年来,随着高通量测序平台及研究方法在疾病基因表达分析的应用,各种疾病的相关机制逐渐从基因和分子层面被阐明[6]。本研究采用基于Affymetrix 芯片平台的GSE42911 数据集,探究溃疡性结肠炎(UC)的发病机制,为其早期诊断和治疗药物的开发提供新思路。

    1 资料与方法

    1.1 基因芯片数据获取 以“Ulcerative Colitis”为关键词,在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中检索与UC 相关的表达谱数据。选择GSE42911 芯片数据进行挖掘,该研究是基于GPL15207 平台(affymetrix human gene expression array)的芯片,由Kellermayer R 提交。由10 个样本构成,分别为GSM1053271、GSM1053272、GSM1053273、GSM1053274、GSM1053277、GSM1053268、GSM1053269、GSM1053270、GSM1053275、GSM1053276。其中,前5 个样本来自5 例溃疡性结肠炎患者 ......

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