基于自噬相关基因构建的预后模型对脑胶质瘤免疫微环境的影响
高风险,1资料与方法,2结果,3讨论
乔秋江,庞 琦(山东大学附属山东省立医院神经外科,山东 济南 250021)
脑胶质瘤(glioma)是当前中枢神经系统最常见的原发性恶性肿瘤,预后较差[1]。胶质母细胞瘤(Ⅳ级)是其中恶性程度最高的一种,中位生存期不足15 个月[2]。异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)突变状态、1p/19q 共缺失和O-6-甲基鸟嘌呤-DNA 甲基转移酶(O-6-Methylguanine-DNA Methyltransferase,MGMT)启动子甲基化等被证明可以预测胶质瘤患者的药物反应及预后[3,4]。也有研究发现[5-7],不同类型胶质瘤中DNA 修复通路的激活、抗凋亡潜能或保护性自噬及胶质瘤干细胞(GSCs)的差异同样导致了预后的不同。由于恶性胶质瘤的肿瘤微环境异质性,目前治疗仍未见明显进展,探究影响胶质瘤肿瘤预后的潜在分子标志物对临床治疗有重要意义。自噬是一种高度保守的细胞动态自我消化过程,主要包括自噬体的形成以及自噬体与溶酶体的融合和降解[8]。自噬有助于维持细胞的能量代谢,也可消除受损细胞器和错误折叠的蛋白质,维持细胞内环境稳定。而过度自噬的发生,可引起细胞死亡,这种死亡方式称为Ⅱ型程序性细胞死亡[9]。自噬对于肿瘤微环境中抗肿瘤免疫中也有重要作用[10],调节肿瘤细胞生存的潜在能力使其成为癌症治疗的目标。缺氧是影响胶质瘤肿瘤微环境的重要因素,可以导致肿瘤细胞的营养不足和基因表达的改变,也影响着细胞内自噬水平的改变[11]。缺氧诱导因子(HIF-1α)是细胞缺氧反应中的重要调控因子,能够影响细胞内自噬相关基因的表达,进而影响肿瘤细胞的免疫微环境。有研究表示[12],缺氧可以激活HIF-1α 依赖的自噬,从而通过抵消细胞毒性T 淋巴细胞和NK 细胞介导的抗肿瘤免疫反应来促进肿瘤细胞的生存。而本研究旨在通过公共数据库挖掘脑胶质瘤缺氧与自噬相关基因的关系,并建立模型预测患者预后和免疫微环境,以期为脑胶质瘤的发生、发展及治疗提供更可靠的依据。
1 资料与方法
1.1 数据下载及数据处理 在Human Autophagy Database(HADb)(http://www.autophagy.lu/)下载232个自噬相关基因 ......
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