长链非编码RNA-MAL2 的靶基因预测及信号通路富集分析
调控,1资料与方法,2结果,3讨论
罗瑶敏,蒋 振(川北医学院基础医学与法医学院生物化学与分子生物学教研室,四川 南充 637000)
长链非编码RNA(lncRNA)是转录本长度超过200 nt 且缺乏蛋白质编码能力的RNA 分子。lncRNA 已被证明参与细胞生长、抗凋亡、迁移和侵袭,而且在多种恶性肿瘤中表现出调控作用,包括乳腺癌、胃癌、胆囊癌、肝细胞癌和胰腺癌[1-4]。MAL2 是一种脂筏蛋白,已知在物质运输中起作用,MAL2 基因在包括乳腺癌在内的各种肿瘤组织中表达,肿瘤细胞中MAL2 水平升高与患者存活率降低相关[5-8]。尽管越来越多的研究表明MAL2 在发病机制、疾病进展、耐药性和生存率降低中的作用,但其作用机制在很大程度上仍不清楚。为此,本研究运用生物信息学分析方法,分析lncRNA-MAL2 在细胞内的调控靶基因及信号通路,并对其进行生物学功能注释,阐述lncRNA-MAL2 在细胞内的功能作用。
1 资料与方法
1.1 lncRNA-MAL2 靶基因预测 经NCBI 基因数据库查询lncRNA-MAL2 的序列 ......
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