倪胜南，陈一鸣

    (江苏省泗阳康达医院检验科，江苏 泗阳 223700)

    扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy，DCM)是临床上较为常见的心肌病，其是一种以左心室或双心室收缩功能障碍为特征的原发性心肌疾病，通常与心脏舒张功能密切相关[1]。流行病学调查发现[2]，DCM 在成人中的患病率约为1/2500，是导致心力衰竭的常见原因，并且其患病率存在明显的年龄和地域差异。据报道[3]，DCM 患者随访52 个月的死亡率为42.24%。DCM 的发病机制包括导致细胞结构和功能异常的基因突变、导致肌肉收缩力产生和传递缺陷的错误信号通路[4，5]。除此之外，血流动力学超负荷增加、心室肌重塑、过度神经体液刺激、肌细胞钙循环异常、心肌能量不足和炎症反应也会导致DCM[6]。但有研究认为[7，8]，DCM 是一种家族性遗传倾向疾病，与遗传密切相关，对患者亲属进行相关基因检测，有利于潜在的DCM 患者识别。然而，目前DCM 的发病机制仍不明确，但较多的研究证据表明DCM 的致病涉及多种生理过程，包括凋亡、坏死和自噬等[9，10]，而在这些生物学过程中，自噬在DCM 的致病过程中发挥着至关重要的作用。虽然研究发现DCM 致病与自噬有相关性，但其具体的作用机制仍尚不明确。基于此，本研究利用生物信息学方法，通过分析来自GEO 数据库中的GSE3586 数据集，探索DCM 自噬相关基因的差异表达，对差异性表达的自噬相关基因利用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、相关分析、基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，从基因转录的层面分析自噬与DCM 的致病关系，为DCM 的治疗及理论研究提供参考。

    1 材料与方法

    1.1 自噬相关基因数据集和微阵列数据 通过人类自噬数据库(http://www.autophagy.lu/index.html)检索获得67 个自噬基因。从GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库下载GSE3586 数据集中样本为室间隔的mRNA 表达谱数据，其中包含13 个DCM室间隔样本和15 个正常人群室间隔样本。

    1.2 自噬相关基因的差异表达分析 利用R 语言通过GEOquery 包从GEO 数据库中下载GSE3586 数据 ......