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编号:449242
GSDMs 家族在子宫内膜癌中的表达情况和预后价值
http://www.100md.com 2023年3月10日 医学信息 2023年第3期
检查点,1材料与方法,2结果,3讨论
     李 丹,黄艳丹,卢 艳

    (广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科,广西 南宁 530021)

    Gasdermin(GSDM)家族蛋白是一组结构相关蛋白,由GSDMA、GSDMB、GSDMC、GSDMD、GSDME(DFNA5)和PJVK(DFNB59)共6 个成员组成,参与细胞增殖死亡、炎症及肿瘤等生理和病理性过程[1-3]。GSDMs 在肝癌、乳腺癌、肺癌、卵巢癌等表达异常,并与患者不良预后相关[4-7]。然而,有关GSDMs 与子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)之间的联系尚不清楚。本研究通过生物信息学方法综合分析GSDMs 家族在内膜癌中的表达情况及预后价值,以期为GSDMs 的靶向治疗提供参考。

    1 材料与方法

    1.1 UCEC 中的GSDMs 家族表达 通过ULACAN 数据库[8](http://ualcan.path.uab.edu/)比较GSDMs 家族在内膜癌组织和正常子宫内膜中的表达水平及与肿瘤分期的关系。

    1.2 GSDMs 家族在UCEC 中的预后生存分析 在Kaplan-Meier Plotter 数据库[9]中从总生存期(OS)、无进展生存期(RFS)两方面分析GSDMs 表达与内膜癌患者预后的关系。

    1.3 UCEC 中GSDMs 及其相关基因的PPI 蛋白相互作用网络和GO 功能、KEGG 通路富集 选择cBioportal 网站[10,11]中的数据集UCEC(TCGA,Firehose Legacy)Complete samples 7 例,以∣Spearman’s correlation∣>0.95,P<0.001 为条件筛选与GSDMs共表达基因。STRING 数据库[12]对GSDMs 家族基因其及共表达基因进行蛋白质互作网络分析 ......

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