郭锦晨，刘健，王茎，周巧，黄旦

    (1.安徽中医药大学新安医学教育部重点实验室，安徽 合肥 230038；2.安徽中医药大学第一附属医院风湿病科，安徽 合肥 230031)

    类风湿关节炎(rheumatoid arthritis，RA)是一种病因尚未完全阐明以滑膜炎和血管炎为基本病理改变的慢性全身性炎症性自身免疫性疾病[1]，其病理机制尚未完全阐明，暂无根治之药，因此探索可靠、准确的生物学标志物对其早期诊断及疗效评估有重大意义。研究证实[2]，单核细胞/巨噬细胞可通过分泌肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素1β(IL-1β)、白细胞介素6(IL-6)等炎性细胞因子来维持RA 患者的炎性环境，还可引起大量的免疫细胞迁移至关节炎，最终导致关节发生不可逆的损伤。研究发现[3]，环状RNA(circular RNA，circRNAs)在RA 患者外周血单核细胞中存在差异表达，部分学者认为可能成为诊断RA 的新型生物标志物，微小核糖核酸(microRNA，miRNA)在免疫细胞分化、成熟、稳态调节方面发挥着重要的作用，部分miRNAs 已证实与T、B淋巴细胞的激活、炎症因子和趋化因子的产生等自身免疫过程相关。circRNA 富含miRNA 的结合位点，大量研究表明可以起到海绵作用作为竞争内源ceRNAs，通过其miRNA 反应元件与miRNA 竞争性结合，然后间接调节miRNA 靶向信使RNA(mRNA)的表达，与RA 的发生发展密切相关[4]。本研究通过对基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus，GEO)中RA 患者和正常对照者的外周血单核细胞测序数据进行分析，研究circRNA、miRNA 及mRNA 差异表达谱，并构建内源性竞争RNA(ceRNA)网络，为探索RA 诊断和治疗的新靶点提供理论依据。

    1 资料与方法

    1.1 资料来源 在GEO 据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)下载RA 患者外周血单核细胞相关数据集：circRNA数据集(GSE189338)、miRNA数据集(GSE124373)和mRNA 数据集(GSE55457)。采用“Limma”软件包校正微阵列数据表达水平，采用“edgeR”软件包对RA 组与正常对照组样本进行差异表达分析，采用“pheatmap”软件包进行热图绘制，LogFC 过滤阈值为1，校正后P(false discoveryrate，FDR)<0.05 设定为筛选标准，如果表达数值很大，需要对数据取Log2 ......