黄向东，张兴伟

    (内蒙古赤峰市医院胸外科，内蒙古 赤峰 024000)

    食管癌(esophageal cancer，EC)是世界上第7 大常见癌症，也是全球第6 大致命的癌症，主要包括食管鳞状细胞癌(ESCC)和食管腺癌(EAC)两种亚型[1]。食管腺癌在欧美国家占主导地位，而食管鳞状细胞癌在我国占主导地位[2]。目前，手术是治疗早期食管癌的首选方法，但因其恶性程度高、进展快、预后差，很多患者一经诊断就失去了手术机会。虽然现有的治疗方法在一定程度上提高了食管癌的生存率，但其5 年生存率仅为20%[3]。现阶段，尚无针对食管癌作用的靶向药物。因此，寻找早期诊断食管癌分子标志物，探索发病机制和治疗靶点具有重要意义。长链非编码RNA(long non-coding RNA，LncRNA)是长度超过200 个核苷酸的非编码RNA，广泛存在于基因组中，由于其在许多生物过程中起关键作用而受到越来越多研究的关注[4]。目前有研究表明[5]，lncRNAs 在肿瘤增殖、转移和微环境中发挥重要作用，并有望成为诊断癌症、预后、转移和耐药性的生物标志物。此外，lncRNA 在不同肿瘤组织中存在着表达差异，并与肿瘤细胞的增殖侵袭以及不良预后相关[6]。本研究基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)中的食管癌表达数据，探索与食管癌预后相关的lncRNA，构建食管癌患者预后预测特征，期待为食管癌患者的潜在治疗靶点提供新的证据支持。

    1 资料与方法

    1.1 数据来源 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库(https://cancergenome.nih.gov/)中下载的食管癌患者的RNA-seq 数据和相应的临床信息。排除没有完整临床数据和生存信息的样本，共得到了158 个食管癌组织样本和11 个正常邻近组织进行后续分析，见表1。基于GENCODE 项目基因注释文件(版本33，GRCh38)[7]对基因符号和生物型进行注释。

    表1 样本中患者的临床数据统计

    1.2 差异表达lncRNAs 和mRNAs 筛选 通过使用“edgeR”包 ......