基于生物信息学分析GLI1 在胃癌中的表达及其临床意义
标志物,检索,1资料与方法,2结果,3讨论
黄 灿,杨侃侃,江 兵,李启信(安徽医科大学附属巢湖医院胃肠外科,安徽 合肥 238000)
胃癌(gastric cancer,GC)是全球第5 大常见恶性肿瘤,也是恶性肿瘤死亡的第3 大原因[1]。胃癌的发病机制十分复杂,具体机制仍不清楚。全身化疗、手术、免疫治疗和靶向治疗均已证实对胃癌有效[2]。尽管近年来较早期胃癌通过外科手术取得了一定的效果,早期手术后5 年生存率可达到60%~80%,但进展期胃癌预后较差[3]。相关基因及分子在胃癌中的异常表达在胃癌的发生发展中起着重要的作用[4]。因此,筛选胃癌诊断和治疗的新靶向分子有利于对胃癌的早期诊断和精准治疗。GLI1 是Hedgehog 信号转导途径末端的转录因子,Hedgehog 途径在癌症中异常激活有两种方式:①配体依赖模式:肿瘤通过自分泌信号过度激活Shh-GLI 途径产生高水平Shh配体;②配体非依赖模式:突变的PTCH 导致SMO结构性激活,导致GLI1 信号失控促进细胞的转化和肿瘤的发生[5]。既往有很多研究发现GLI1 与多种癌症的发生发展有着重要关系,包括结肠癌[6]、胶质瘤[7]、食道癌、膀胱癌[8]、骨肉瘤[9]、乳腺癌[10]等。但目前
GLI1 在胃癌中的研究尚不明确。本研究运用多种癌症基因数据库分析GLI1 在胃癌中的表达情况,同时探讨GLI1 基因表达对胃癌患者预后及免疫影响,旨在为深入研究GLI1 的靶向治疗提供思路。
1 资料与方法
1.1 资料来源 检索TIMER 数据库(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)检索GLI1 在泛癌中的表达情况,检索条件为:①Exploration:Gene Diff Exp;②Gene Expression:select GLI1。利用UALCAN 数据库(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)先检索GLI1在泛癌中的表达随后在STAD 中临床相关性表达的相关信息,检索条件为:①Gene symbol:GLI1;②pan-cancer view;③Gene Expression;④Select Cancer:Stomach adenocarcinoma;⑤GLI1 expression based on:Sample types ......
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