张 政，卢鸿健，李明慧，高文博，田 宇，王嘉祺，张荣花，章广玲

    (1.华北理工大学临床医学院/河北省医工融合精准医疗重点实验室，河北 唐山 063000；2.华北理工大学基础医学院/河北省慢性疾病基础医学重点实验室，河北 唐山 063210)

    肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是世界上常见的恶性肿瘤之一，占原发性肝癌的75%～85%。GLOBOCAN 的最新统计数据显示[1]，2020 年全球HCC 新发病例达91 万，死亡病例83 万，分别居肿瘤新发病率第6 位、死亡率第3 位；我国人口占世界的18%，但新发病例占全球的45%。HCC 的发生发展过程复杂，是一种异质性较高的癌症，大多数发现时已是中晚期，错过了手术的最佳时间且预后较差，其5 年总生存率只有12%[2]。因此，寻找HCC 发展过程中有效的靶点和信号通路并进行相应干预，对延缓HCC 的进展或者逆转具有重要意义。研究表明[3]，非编码RNA(non-coding RNA，ncRNA)包括长链非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)和微小RNA(microRNA，miRNA)等，其可能在HCC 的发生发展中发挥了重要的作用。miRNAs 分子由18～25个bp 组成的非编码RNA，能够通过碱基互补配对与靶基因的3' 端非编码区(3'untranslated region，3'UTR)特异性结合，沉默或降解靶mRNAs 从而影响其翻译功能。lncRNAs 分子是一种长度超过200 bp 的非编码核苷酸，含有miRNAs 的结合位点，可以作为miRNAs 的“海绵”吸附miRNAs，从而竞争性抑制miRNAs 对靶mRNAs 的作用[4]。本研究拟通过生物信息学方法探究癌症基因组图谱(TCGA)数据库中HCC 组织中差异表达的基因，并构建lncRNAmiRNA-mRNA 调控网络，为靶向诊断和治疗HCC提供科学依据。

    1 资料与方法

    1.1 HCC 组织中差异表达基因的筛选 利用R 软件DESeq2 包分析TCGA 数据库中374 例HCC 组织与50 例正常肝组织中lncRNAs、miRNAs、mRNAs 的表达谱。使用R 软件ggplot2 包对表达谱数据绘制火山图，以|Log2FC|>1(fold change 差异倍数大于2 倍)且P<0.05 作为筛选标准。

    1.2 miRNAs 转录因子的预测 利用FunRich 软件预测差异表达miRNAs 的转录因子，根据其所调控的基因数和值进行排序 ......