王 涛，侯润博，潘 鑫

    (锦州医科大学医疗学院医学系1，医学技术系2，辽宁 锦州 121013)

    Ⅰ型糖尿病作为一种慢性疾病主要是由胰岛β细胞受损引起，胰腺或胰岛移植可以彻底根治，但是由于供体缺乏以及免疫排斥大大限制该治疗方案的临床应用[1，2]，干细胞分化为胰岛素分泌细胞(insulinproducing cells，IPCs)再行移植，有望成为Ⅰ型糖尿病治疗的新策略[3，4]。miRNA 作为一类小的非编码RNA，其长度大约在22 个核苷酸左右，能够与靶mRNA 3’端非翻译区互补，进而降解或阻止该mRNA 翻译出蛋白质，实现转录后水平的基因表达调控[5，6]。生物信息学通过整合多个学科领域信息和知识，能够整体层面揭示疾病或生物过程的复杂分子机制[7]，而且其通过对已有实验数据的分析，能够减少重复实验所带来的资源浪费。GEO 数据库是生物信息学研究重要的中心资源之一，其存储大量高通量数据，但是大部分数据并未被充分利用[8]。目前，运用生物信息学分析干细胞向IPCs 诱导分化过程中miRNA-mRNA 的调控网络报道较少见。因此，本研究运用生物信息学方法分析干细胞向IPCs 诱导分化过程中的mRNA 表达谱，并构建miRNAmRNA 调控网络。

    1 资料与方法

    1.1 一般资料 通过NCBI 的GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)检索人胚胎干细胞(human embryonic stem cells，hESCs)向IPCs 诱导分化过程中mRNA 表达谱的相关数据，最终只有GSE42094 数据集符合要求，该数据集基于GPL10558 平台，包含23 个样本数据(GSM1032319-41)，涉及未分化hESCs(WA09)、IPCs 分化的5 个时期、胰腺内胰岛和胎胰。

    1.2 数据处理与差异表达分析 选择GSE42094 数据集内的未分化hESCs 和IPCs 分化的5 个时期进行研究，进入“Analyze with GEO2R”项目，点击“Define groups”设定分组，其中，hESCs 组包含3 个样本，Diff1 组3 个，Diff2 组3 个，Diff3 组2 个，Diff4 组2个，IPCs 组3 个，对6 组数据进行差异表达分析，筛选标准设定为adj.P<0.05。

    1.3 GO 功能和KEGG 路径显著性分析 为分析差异表达基因的潜在生物学功能，选用DAVID(https://david.ncifcrf.gov/tools.jsp)数据库进行功能富集分析 ......