裴 薇，汪鹏刚，刘登瑞，高明太

    (兰州大学第一医院小儿外科，甘肃 兰州 730000)

    肝母细胞瘤(hepatoblastoma，HB)是儿童最常见的肝脏恶性肿瘤，约占儿童肝脏原发性恶性肿瘤的50%～60%。该病多在5 岁以内发生，起病隐匿，易发生远处转移[1，2]。有研究表明[3-6]，N6-甲基腺苷的高表达与HB 的发病途径密切相关，同时ZFAS1、TUG1、TNFRSF19、TRIB1 和TOP2A 等在参与细胞增殖、凋亡、谷氨酰胺分解、调控信号通路等过程中发挥重要作用。现阶段临床医师主要根据临床表现、影像学和甲胎蛋白(AFP)水平确定HB，但由于患儿的AFP来源众多，其敏感度和特异度均不足，造成早期诊断技术缺乏。高达80%的确诊患儿需通过完整的手术切除和术后放化疗得以生存。手术后的化疗可能对患儿产生长期负面影响，导致部分患儿预后不良。因此，开发新的有效的肝母细胞瘤诊断和治疗方法，发现新的、稳定的生物标志物已成为亟待解决的问题。随着高通量测序技术的发展，越来越多异常表达的mRNA 在HB 中被发现。微阵列技术和生物信息学分析被广泛应用于筛选基因组水平的遗传改变。在独立的微阵列分析中，假阳性率使得其难以获得可靠的结果。本研究拟从Gene Expression Omnibus(GEO)下载mRNA 芯片数据集，在利用GEO数据库中的数据集揭示HB 中可靠的差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)，并发现关键基因(hub genes)，进行功能富集分析，希望能为该病新的诊断和治疗方法提供候选生物标志物。

    1 资料与方法

    1.1 资料来源 从GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)[7]下载3 个人类肝母细胞瘤基因表达数据集(GSE131329[8]、GSE132219[9]和GSE75271[10])，根据平台中的注释信息将探针转换为相应的基因符号。GSE131329 数据集包含53 例HB 组织样本和14 例非肿瘤样本；GSE132219 包含31 例HB 样本和18例非肿瘤样本；GSE75271 包含5 例HB 样本和5 例非肿瘤样本。

    1.2 鉴定DEGs 采用GEO2R(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r)筛查HB 与非肿瘤样本之间的DEGs。分别去除没有对应基因符号的探针集和有多个探针集的基因，整理3 组数据的DEGs，logFC(fold change)>1 和adj.P<0.01 被认为有统计学意义 ......