长链非编码TINCR介导乳腺癌化疗耐药的生物信息学分析




摘要:目的" 探讨长链非编码RNA-TINCR在耐药性乳腺癌中的表达、生物学功能、相关信号通路及其与患者预后的关系。方法" 利用GEPIA在线数据库比较人乳腺癌组织和正常组织中TINCR基因的mRNA的相对表达水平,通过qPCR方法验证敏感、耐药乳腺癌细胞中TINCR的表达量,借助Kaplan-Meier ploter在线数据库分析TINCR表达量高低与乳腺癌患者生存预后的关系。采用CCK8法检测改变TINCR表达量对肿瘤细胞化疗敏感性的改变,Metascape在线数据库预测TINCR的相互作用蛋白,借助DAVID对相关基因功能进行GO和KEGG 信号通路功能富集分析。最后初步探讨耐药细胞中异常表达的TINCR是如何产生的。结果" TINCR在乳腺癌组织及耐药乳腺癌细胞中高表达,升高TINCR表达水平可促进乳腺癌细胞对化疗药物的耐药,分析出TINCR相互作用蛋白有150个,这些蛋白调控蛋白质翻译、mRNA和rRNA的加工、mRNA的出核转运、核糖体小亚基的形成等生物学过程,信号通路富集结果主要分布在核糖体、冠状病毒疾病、剪切体、核质运输、mRNA监测通路等方面。TINCR启动子区具有ERα结合,且使用ERα抑制剂可显著抑制TINCR表达量。结论" TINCR在耐药乳腺癌细胞中呈高表达水平,与患者的预后不良有关,对乳腺癌化疗耐药的预测具有重要意义。
关键词:TINCR;乳腺癌;化疗耐药;生物信息学
中图分类号:R737.9" " " " " " " " " " " " " " " " " 文献标识码:A" " " " " " " " " " " " " " " " DOI:10.3969/j.issn.1006-1959.2023.15.001
文章编号:1006-1959(2023)15-0001-06 ......
您现在查看是摘要页,全文长 14987 字符。