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编号:448932
结核分枝杆菌TB10.4 蛋白的生物信息学分析
http://www.100md.com 2023年9月20日 医学信息 2023年第18期
表位,磷酸化,结核病,1资料与方法,2结果,3讨论
     高 灿,赵晓彤,程 江,2

    (1.石河子大学医学院,新疆 石河子 832008;2.石河子大学医学院第一附属医院检验科,新疆 石河子 832008)

    结核病(TB)是一种由结核分枝杆菌(M.tb)引起的传染性疾病[1,2]。目前,结核病的感染控制主要靠接种减毒牛分枝杆菌卡介苗(BCG)来实现,但BCG并不能对各个年龄组都起到有效的防护作用[3]。分枝杆菌的耐药性仍在不断出现不断增加,全球健康遭到了耐药结核菌株的严重威胁,将促使开发替代治疗方法。Rv0288(esxH)是分枝杆菌蛋白大家族ESAT-6 家族(ESAT6,ESX)的一名成员,编码分泌蛋白TB10.4 蛋白[4]。研究发现[5],该基因的表达可以改变INH 和RIF 存在下分枝杆菌的生长,与结核病耐药性存在潜在关联。除此之外,TB10.4 蛋白有可能参与铁/锌摄取,这一过程在是结核分枝杆菌生长代谢中起重要作用[6,7]。另有研究发现[8],Rv0288 基因中的编码蛋白TB10.4 能刺激机体产生细胞免疫,具有一定的免疫原性,使结核病人的免疫系统被识别。因此TB10.4 蛋白有可能成为候选抗原和候选疫苗,用于结核分枝杆菌感染的诊断[9,10]。本研究通过生物信息学技术对结核分枝杆菌TB10.4 蛋白的结构和功能进行预测,以探索TB10.4 蛋白的结核耐药性机制,寻找其在结核病的药物新靶点及预防方面的潜在应用价值。

    1 资料与方法

    1.1 一般资料 TB10.4 蛋白氨基酸序列来自NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)网站。在GenBank 中检索关键词Rv0288,以获取H37Rv 全基因组信息。RV0288 基因位于MTB 全基因组的区域,基因ID为 886603;它的编码蛋白为TB10.4 蛋白(别名Cfp7,Low molecular weight protein antigen 7 EsxH,ESAT-6-Like protein EsxH),属于分泌蛋白,在蛋白质库中的登录号为CCP43018.1,在UniProt 中的登录号为P9WNK3。通过NCBI 网站查询,TB10.4 蛋白由96 个氨基酸序列组成,检索的氨基酸序列如下:MSQIMYNYPAMLGHAGDMAGYAGTLQSLGAEIAV EQAALQSAWQGDTGITYQAWQAQWNQAMEDLVR AYHAMSSTHEANTMAMMARDTAEAAKWGG。

    1.2 方法 使用NCBI 网址中的OFR Finder 软件分析基因Rv0288 的开放阅读框架;应用在线软件ProtParam、ProtScale 对TB10.4 蛋白进行理化性质及亲疏水性分析 ......

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