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编号:449060
基于GEO 数据库及网络药理学探讨六郁汤辅助治疗重度抑郁症的作用机制
http://www.100md.com 2023年11月2日 医学信息 2023年第20期
槲皮素,抗抑郁,靶点,1材料与方法,2结果,3讨论
     谢淑君,袁海静,范婷婷,杨宏光

    (广州中医药大学第三附属医院血液肿瘤科,广东 广州 510378)

    重度抑郁症(major depressive disorder,MDD)是一种复杂的、多因素的、高度异质性的精神疾病。据统计,我国成人抑郁障碍终生患病率高达6.8%[1],其中重度抑郁症在青少年中的发病率高达4.8%[2],MDD 因高患病率和致残率,给社会和家庭带来沉重负担。目前抗抑郁药仍是重度抑郁症的一线治疗手段,但起效较慢且效果有限[3]。中医药可通过多途径、多靶点、多层次发挥抗抑郁作用,在抑郁症的治疗上具有不可替代的独特优势[4]。六郁汤出自《医学正传》,由半夏、陈皮、苍术、川芎、茯苓、栀子、香附、炙甘草、砂仁组成。研究证据显示,六郁汤具有抗抑郁[5,6]、改善抗精神病药所致的代谢综合征等作用[7],但其具体作用机制尚不明确。本研究联合GEO 数据库及网络药理学和分子对接的方法探讨六郁汤辅助治疗重度抑郁症的潜在机制,以期为重度抑郁症的治疗用药提供更多的理论依据。

    1 材料与方法

    1.1 六郁汤活性成分及靶点 筛选基本药物的ADME 模型,设置“口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18”为筛选指标[8],分别以“陈皮、半夏、苍术、川芎、茯苓、栀子、香附、甘草、砂仁”为检索词,检索中药系统药理分析平台数据库(TCMSP,https://tcmsp-e.com/),获取六郁汤主要活性成分及对应靶点;运用Perl 脚本(https://www.perl.org/)结合UniProtKB 数据库(https://www.uniprot.org/)中已验证的人类基因对成分靶点进行标准化命名。

    1.2 MDD 潜在作用靶点筛选 利用GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/),以“Major depressive disorder ”为检索词,获取序列号为GSE76826 的基因芯片矩阵和注释文件。此芯片为32 个血液样本的基因表达谱数据,其中20 个来自MDD 患者(试验组),12 个来自健康人群(对照组)。使用R 语言limma 对芯片数据进行分析获取MDD患者与健康人的差异表达基因(|logFC|>0.05,P<0.05)。按照P值筛选前20 个差异基因绘制基因热图和火山图。以“Major depressive disorder”为检索词,逐一检索OMIM 数据库(https://www.omim.org/)、TTD 数据库(http://db.idrblab.net/ttd/)、Genecards 数据 库(http://www.genecards.org)、Durgbank 数据库(https://go.drugbank.com/)、PharmGKB 数据库(https://www.pharmgkb.org) ......

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