单细胞测序技术在妇科恶性肿瘤中的应用
上皮,浆液,1单细胞测序技术,2单细胞测序技术与CC,3单细胞测序与子EC,4单细胞测序与OC,5总结
朱志英,黄金智,李玉婷,陈 影,陈冀莹(1.广东医科大学第一临床医学院,广东 湛江 524000;2.深圳市龙华区中心医院妇产科,广东 深圳 518110;3.佛山市顺德区妇幼保健院妇科,广东 佛山 528300;4.广东医科大学附属医院妇产科,广东 湛江 524000)
肿瘤的发生发展是一个复杂且多阶段的过程,当内外源性因素引起基因组的不稳定时,易导致基因突变,突变的基因不断增殖和积累最终引起细胞表型发生改变,从而发生恶性分化。在细胞分化过程中,肿瘤细胞中遗传特性差异是发生复杂的肿瘤异质性的主要原因[1]。目前,研究者们对肿瘤细胞间的异质性及其形成机制了解不足,使大多数癌症患者的临床诊断及治疗方法仍面临着巨大的挑战。单细胞测序(single-cell sequencing,SCS)技术的引入,彻底改变了研究者们对肿瘤的了解[2]。随着单细胞RNA 测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术的不断创新,为深入研究肝癌、肺癌、妇科恶性肿瘤及血液系统等疾病的发生发展机制、治疗、转移及预后等提供了技术支持[3-5]。宫颈癌(cervical cancer,CC)、子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)和卵巢癌(ovarian tumor,OC)是最常见的妇科恶性肿瘤,发病率呈逐年上升趋势,且呈现年轻化趋势。近几年,免疫治疗及靶向治疗虽然使部分患者获益,但仍无法满足患者的需求。主要是由于肿瘤在发生发展过程中,不同群体的基因异质性在肿瘤微环境中不断产生、扩增并与细胞相互作用,导致细胞代谢异常、免疫逃避以及耐药的发生[6]。目前为止,scRNA-seq技术在妇科恶性肿瘤中的研究较少,尚有较大的研究空间,有望在该领域取得重大突破。基于此,本文主要对近几年scRNA-seq 技术在妇科恶性肿瘤中的应用进行综述,以期为未来研究者提供研究方向和理论基础。
1 单细胞测序技术
scRNA-seq 技术指在单个细胞水平上,对基因组或转录组进行扩增并测序的一项变革性新技术。自1975 年英国科学家Sanger F[7]发明了第一代基因测序以来,基因测序逐渐成为人们探索细胞遗传物质变化和发病机制的强有力工具。2009 年,Tang F等[8]首次在Nature Methods 杂志上发表从单个细胞水平上的转录组测序相关文章,从此打开了scRNA-seq 的大门。相对于传统测序,scRNA-seq 最显著优势是更为精准 ......
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