基于生物信息学分析二仙汤治疗膝关节骨性关节炎合并骨质疏松症的机制
靶标,骨细胞,1数据来源与方法,2结果,3讨论
汪 青,黄昊强,陈 勇,徐 锋,彭志坚(昆山市中医医院骨科,江苏 昆山 215300)
骨质疏松症(osteoporosis,OP)及膝关节骨性关节炎(knee osteoarthritis,KOA)都是年龄相关的退行性骨骼疾病,两者在流行病学、发病机制及病理变化等诸多方面有共同点[1]。中医药具有多靶点多途径的特点,在膝关节骨性关节炎与骨质疏松症共病治疗上具有一定的价值。二仙汤由上海中医药大学张伯纳教授创制,临床用于骨质疏松症具有不错的疗效;然而该方对于膝关节骨性关节炎与骨质疏松症共病治疗是否有作用,仍不清楚。本研究应用生物信息学的方法,筛选出二仙汤、膝关节骨性关节炎及骨质疏松症共同的靶点并进行分析,旨在为二仙汤临床治疗膝关节骨性关节炎与骨质疏松症共病提供理论依据。
1 数据来源与方法
分别以骨质疏松症及膝关节骨性关节炎作为关键词,在疾病数据库[Disgenet(https://www.disgenet.org/home/)、TTD(http://db.idrblab.net/ttd/)、Genecards(https://www.genecards.org/)]中筛选靶点,其中Disgenet 评分≥0.1,Genecards 筛选相关度≥5。在中药数据库平台(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)筛选二仙汤六味中药(仙茅、仙灵脾、巴戟天、当归、知母、黄柏)的有效化合物,通过Netinfer 平台(http://lmmd.ecust.edu.cn/netinfer/)预测二仙汤的靶标。使用Venny2.1.0 进行交集,获得二仙汤治疗OP 合并KOA 的靶点,通过String 数据库(https://cn.stringdb.org/)制作靶点间相互作用PPI 网络 ......
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