基于生物信息学分析糖酵解相关基因对DLBCL免疫微环境的影响
祁玉娇 刘聪聪 黄大帅 李红玲


基金项目:国家卫健委胃肠肿瘤诊治重点实验室2022年度硕博士/博士后基金项目(编号:NHCDP2022005)
作者簡介:祁玉娇(1994.3-),女,甘肃镇原县人,硕士研究生,主要从事淋巴瘤的研究
通讯作者:李红玲(1969.12-),女,甘肃兰州人,博士,主任医师,主要从事淋巴瘤的研究
摘要:目的? 探讨基于糖酵解相关基因预测弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的肿瘤免疫微环境,并研究其潜在机制。方法? 从NCICCR数据库中下载DLBCL患者的RNA-seq数据和相应的临床信息,基于糖酵解相关基因,采用共识聚类的方法将其分为C1簇和C2簇。采用Kaplan-Meier(K-M)生存分析、ESTIMATE、TIMER和ssGSEA分析来确定所识别的2个簇类之间的生存、功能和肿瘤微环境(TME)的差异性。通过GO、KEGG和GSEA功能分析阐明其潜在机制。结果? 2个簇类之间的生存率显著不同;K-M生存曲线表明,C1簇的存活率高于C2簇,并且免疫评分、ESTIMATE评分与基质评分高于C2簇。GO和KEGG分析表明,两簇之间的差异性表达基因主要在细胞外基质和免疫途径中富集。GSEA分析显示,免疫通路在C1簇的富集度高于C2簇。结论? 差异性表达基因于C1簇中与肿瘤免疫微环境显著相关,并且生存率高于C2簇。说明糖酵解代谢失调导致了肿瘤免疫微环境的损害,从而导致DLBCL预后不良。
关键词:弥漫大B细胞淋巴瘤;免疫微环境;糖酵解;预后
中图分类号:R733.4? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文献标识码:A? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?DOI:10.3969/j.issn.1006-1959.2024.09.001 ......
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