翟堃 刘絮影 李锦存 胡晨 于丽丽 樊美荣 黄永清 马坚

    摘要：目的? 利用转录组测序技术对口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织进行测序，筛选OSCC中差异表达的环状RNA(circRNA)，并探讨可能与OSCC相关的信号通路。方法? 收集3对OSCC患者的癌及癌旁正常组织，提取总RNA，构建circRNA文库，对其进行转录组测序，获得circRNA表达谱，筛选差异表达circRNA并进行GO和KEGG分析；构建ceRNA网络，分析预测circRNA在OSCC中的作用，并利用cytoscape软件对网络进行可视化。结果? 本研究鉴定出了差异表达的circRNA281个，上调的有33个，下调的有248个。GO富集分析中主要参与细胞器组织的调节、GTP酶活性的调节；细胞组分主要在锚定连接、P小体；分子功能在核苷三磷酸酶调节活性、GTPase激活剂活性等生物学过程；KEGG主要富集在肌动蛋白细胞骨架的调节、调节干细胞多能性的信号通路、ErbB信号通路、细胞粘附连接等通路。最终筛选出7个差异表达的circRNA、2个差异表达的miRNA和3个差异表达的mRNA。结论? 通过转录组测序鉴定出口腔鳞状细胞癌circRNA几乎全部为的外显子circRNA，主要富集在肌动蛋白细胞骨架的调节、GTP酶活性的调节等通路。

    关键词：口腔鳞状细胞癌；环状RNA；转录组测序

    中图分类号：R739.8? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文献标识码：A? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?DOI：10.3969/j.issn.1006-1959.2024.12.001

    文章编号：1006-1959(2024)12-0001-06

    Transcriptome Sequencing in Screening Differentially Expressed Circular RNAs ......