硫酸软骨素蛋白多糖4预后价值的泛癌分析
肺腺癌,基因突变






摘要:目的" 分析CSPG4在不同肿瘤中的表达对预后的影响及其可能作用的生物学通路。方法" 使用TIMER和UALCAN分析CSPG4在泛癌中mRNA和蛋白质的表达情况,GEPIA分析癌组织和癌旁组织中CSPG4表达差异及其对肿瘤患者生存时间的影响。使用R语言clusterProfiler和org.Hs.eg.db程序包对CSPG4进行基因本体论(GO)功能富集分析,clusterProfiler和pathview程序包进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。用于GO和KEGG通路富集分析的CSPG4表达数据及相应的临床信息均来自于癌症基因组图谱(TCGA)数据库。结果" 在多形性胶质细胞瘤和头颈鳞状细胞癌的癌组织中,CSPG4在mRNA和蛋白水平均呈高表达。在乳腺癌、结肠癌、肺腺癌和子宫内膜癌中呈低表达。预后分析显示,CSPG4在肺腺癌中高表达,与肿瘤患者的不良预后显著相关(HR=1.4,P<0.05)。GO功能富集分析结果显示,CSPG4相关基因主要富集在肌动蛋白结合、细胞外基质结构成分和糖胺聚糖结合等。KEGG通路富集分析结果显示,CSPG4作用的信号通路主要集中于粘着斑、人乳头瘤病毒感染以及PI3K-Akt信号通路。结论" CSPG4可能通过与机动蛋白结合,影响细胞外基质组分或通过PI3K/AKT信号通路参与肺腺癌的发生发展过程 ......
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