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编号:2279052
WGCNA联合机器学习法探究缺氧与慢性髓系白血病潜在靶点与作用机制研究
http://www.100md.com 2024年12月31日 医学信息 2024年第19期
    

    摘要:目的" 通过WGCNA联合机器学习法鉴定缺氧与慢性髓系白血病(CML)潜在关键基因,并探讨关键基因与CML中22种免疫细胞的组成和成分分布。方法" 将高通量基因表达数据库(GEO)中的两个CML数据集(GSE5550和GSE24739)进行整合,消除批次效应。采用微阵列数据线性模型(LIMMA)在25例CML和16例对照中对200个缺氧基因进行差异分析。采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选出相关模块,联合SVM-RFE分析和LASSO回归模型筛选关键基因。三种算法做Venn分析。免疫浸润中的CIBERSORT算法评估CML中22种免疫细胞组分的组成模式以及关键基因与22种免疫细胞相关性。结果" 共鉴定出34个与CML相关缺氧基因 ......

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