摘要：目的" 构建乳腺癌脑转移中miRNA-TF-mRNA调控网络。方法" 从GEO数据库下载乳腺癌脑转移相关的miRNA和mRNA表达数据集，通过GEO2R对数据集进行差异分析。使用miRWalk、TargetScan和miRDB工具预测差异表达miRNAs的下游靶mRNAs，并与差异表达mRNAs进行交叉匹配，同时进行GO和KEGG功能富集分析。利用String数据库构建交叉mRNAs的PPI网络图并筛选关键靶mRNAs。通过FunRich软件预测靶mRNAs的转录因子(TFs)，并利用Cytoscape 软件构建乳腺癌脑转移中相关的miRNA-TF-mRNA 调控网络。结果" 共筛选出差异表达的miRNAs 54个，全为上调miRNAs。预测的下游靶mRNAs与差异表达mRNAs取交集共筛选出41个候选靶mRNAs。GO分析显示其生物过程主要参与基因表达的正调控等，分子功能主要参与涉及调控RNA聚合酶Ⅱ转录因子的活性；KEGG通路分析显示主要集中在癌症相关的Ras信号通路。String数据库构建候选靶mRNAs的PPI网络图，筛选出包括SUMO1、DAXX、UBA2、RBX1等在内的23个关键mRNAs。FunRich软件预测获得10个调控关键mRNAs的TFs，包括SMAD1、HOXA3、FOXO1等。利用Cytoscape软件构建miRNA-TF-mRNA调控网络，得到3个miRNAs节点、10个TFs节点、23个候选靶mRNAs节点。结论" miR-532-3p、miR-1224-5p、miR-877-5p和SMAD1、HOXA3、FOXO1等TFs、以及SUMO1、DAXX、UBA2等关键靶mRNAs可能在乳腺癌脑转移发生发展过程中构成重要的miRNA-TF-mRNA调节网络。

    关键词：乳腺癌脑转移；微小RNAs；生物信息学；miRNA-TF-mRNA调控网络

    中图分类号：R730.1" " " " " " " " " " " " " " " " "文献标识码：A" " nbsp; " " " " " " " " " " " " " "DOI：10.3969/j.issn.1006-1959.2025.06.002 ......