3.2 微生物转化的不足 由于中药现代化历程尚为短暂，且中药成分复杂，使得微生物转化中药仍然处于研究初期阶段，并存在一些需要改进的不足之处。(1)菌种的选育与分离筛选是中药微生物转化生产的基础和关键。自然界分离筛选的效率低下。(2)现阶段的微生物转化尚具有较大的盲目性。微生物转化主要是通过底物与微生物混合体系发酵进行生物转化，这个过程变量多、体系复杂、难以进行分解研究，在合成上无法进一步阐述真正催化化学反应的酶系特点。(3)特异性差。若菌株发生变异，酶系类型也可能发生变化。现阶段微生物转化产物并不能提前预测反应结果，更难以从底物合成目标转化产物，转化后的成分鉴定和纯化工作繁杂。(4)若转化的底物有毒性，会杀死微生物导致转化无法进行。

    针对以上不足，我们可以综合运用物理化学诱变技术、基因重组工程技术和原生质体融合技术选育优良菌种。同时，应增加对微生物转化菌株酶系的研究，利用多种生化手段，对转化酶系的分离、提纯、表征和功能进行研究，阐明底物在特定酶系下的转化过程和转化机制 ......