一个鼻咽癌相关EST的鉴定及其全长cDNA序列分析(1)
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摘 要：鼻咽癌是我国南方及东南亚地区常见的恶性肿瘤之一。通过对鼻咽癌染色体高频率杂合性丢失区域3p21的表达序列标签(expressed sequencetag，EST)进行同源性比较分析，运用逆转录聚合酶链式反应的方法，筛选到一个在41.18%(14/34)的鼻咽癌活检组织及20.0%(1/5)的鼻咽癌细胞系中表达下调的ESTBC772301；并用Northern杂交方法，检测了该EST在多种正常成人组织中的表达状况及其所代表基因的转录本大小。在此基础上，对该EST来源的cDNA克隆(1MACE：4839190)进行直接测序，获得了一个全长为2377bp的新cDNA序列；经生物信息学分析，发现它与已知基因序列无明显同源性，属于一个新基因，定位于染色体3p21.3，被命名为鼻咽癌表达下调基因(NPCEDRC，GenBank登录号：AF538150)。其编码的蛋白质含169个氨基酸，与一个已报道的在进化上相对保守、功能未知的人类蛋白Nicolinl(简称NICNl)N端170个氨基酸残基的序列同源性为97%，但缺少NICNl蛋白C端43个氨基酸残基，可能是nicoUnl基因不同剪接本的编码产物。
关键词：鼻咽癌；表达序列标签：全长cDNA；序列分析
中圈分类号：R730
文献标识码：A
文章编号：1007-7847(2006)02—0172-06
鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma，NPC)是我国南方常见的一种恶性肿瘤。目前认为：NPC具有遗传易感性背景和复杂的遗传学改变，且与EB病毒感染和环境化学致癌因素相关，其发病遵循典型的多基因一环境交互作用模式。细胞及分子遗传学研究表明，NPC存在多个染色体部位如：3p、3q、9p、11q、12q、13q、14q和16q等非随机性的缺失或扩增 ......
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