人胚胎干细胞和拟胚体基因表达谱的初步分析
基因芯片,生物信息学分析,差异表达基因,自我更新,细胞分化,未分化,表达下调
参见附件(445kb)。
赵明 任彩萍 杨红 蒋星军 曾英 王磊 周文 祝斌 冯湘玲 姚开泰 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学神经外科 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所
【摘要】利用人类全基因组Affymetrix芯片检测人胚胎干细胞与其自发分化7d的拟胚体之间的差异表达基因.结果显示:与未分化的人胚胎干细胞相比,在分化7d的拟胚体中表达下调2倍及以上的已知和未知基因共有1100个,表达上调2倍及以上的已知或未知基因共有2283个.利用Gostat对这些差异表达基因进行功能分析,发现它们分别与细胞的生物代谢过程、信号传导通路、系统发育、细胞分化、分子功能及亚细胞组分相关.胚胎干细胞具有自我更新能力,是研究早期胚胎发育理想的细胞模型,因此对差异表达基因的功能研究有助于了解维持人胚胎干细胞自我更新的分子机制以及胚胎发育早期的分子事件.
【关键词】 人胚胎干细胞 拟胚体 基因芯片 生物信息学分析 差异表达基因 基因表达谱 自我更新 细胞分化 未分化 表达下调
【基金】国家自然科学基金资助项目(30200140) 湖南省自然科学基金资助项目(07JJ3038)
【分类号】Q78
基因注释(GeneOntology)是对基因的生物学过程(biologicalprocess)、细胞成分(cellularcomponent)和分子功能(molecular function)等方面进行相应的注释.Harhay等[1]研究指出在功能基因组时代Gene Ontology能为基因的功能研究提供重要信息.而Gostat是分析基因芯片结果、寻找
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摘要：利用人类全基因组Affymetrix芯片检测人胚胎干细胞与其自发分化7d的拟胚体之间的差异表达基因，结果显示：与未分化的人胚胎干细胞相比。在分化7d的拟胚体中表达下调2倍及以上的已知和未知基因共有1100个，表达上调2倍及以上的已知或未知基因共有2283个，利用Gostat对这些差异表达基因进行功能分析，发现它们分别与细胞的生物代谢过程、信号传导通路、系统发育、细胞分化、分子功能及亚细胞组分相关，胚胎干细胞具有自我更新能力，是研究早期胚胎发育理想的细胞模型，因此对差异表达基因的功能研究有助于了解维持人胚胎干细胞自我更新的分子机制以及胚胎发育早期的分子事件，关键词：人胚胎干细胞；拟胚体；基因芯片；生物信息学分析
中图分类号：R3
文献标识码：A
文章编号：1007-7847(2008)01-0061-05
Preliminary Study on Gene Expression Profiling of Human Embryonic Stem Cells and Embryoid Bodies
注：本文中所涉及到的图表、注解、公式等内容请以PDF格式阅读原文
赵明 任彩萍 杨红 蒋星军 曾英 王磊 周文 祝斌 冯湘玲 姚开泰 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学神经外科 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所 中南大学肿瘤研究所
【摘要】利用人类全基因组Affymetrix芯片检测人胚胎干细胞与其自发分化7d的拟胚体之间的差异表达基因.结果显示:与未分化的人胚胎干细胞相比,在分化7d的拟胚体中表达下调2倍及以上的已知和未知基因共有1100个,表达上调2倍及以上的已知或未知基因共有2283个.利用Gostat对这些差异表达基因进行功能分析,发现它们分别与细胞的生物代谢过程、信号传导通路、系统发育、细胞分化、分子功能及亚细胞组分相关.胚胎干细胞具有自我更新能力,是研究早期胚胎发育理想的细胞模型,因此对差异表达基因的功能研究有助于了解维持人胚胎干细胞自我更新的分子机制以及胚胎发育早期的分子事件.
【关键词】 人胚胎干细胞 拟胚体 基因芯片 生物信息学分析 差异表达基因 基因表达谱 自我更新 细胞分化 未分化 表达下调
【基金】国家自然科学基金资助项目(30200140) 湖南省自然科学基金资助项目(07JJ3038)
【分类号】Q78
基因注释(GeneOntology)是对基因的生物学过程(biologicalprocess)、细胞成分(cellularcomponent)和分子功能(molecular function)等方面进行相应的注释.Harhay等[1]研究指出在功能基因组时代Gene Ontology能为基因的功能研究提供重要信息.而Gostat是分析基因芯片结果、寻找
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摘要：利用人类全基因组Affymetrix芯片检测人胚胎干细胞与其自发分化7d的拟胚体之间的差异表达基因，结果显示：与未分化的人胚胎干细胞相比。在分化7d的拟胚体中表达下调2倍及以上的已知和未知基因共有1100个，表达上调2倍及以上的已知或未知基因共有2283个，利用Gostat对这些差异表达基因进行功能分析，发现它们分别与细胞的生物代谢过程、信号传导通路、系统发育、细胞分化、分子功能及亚细胞组分相关，胚胎干细胞具有自我更新能力，是研究早期胚胎发育理想的细胞模型，因此对差异表达基因的功能研究有助于了解维持人胚胎干细胞自我更新的分子机制以及胚胎发育早期的分子事件，关键词：人胚胎干细胞；拟胚体；基因芯片；生物信息学分析
中图分类号：R3
文献标识码：A
文章编号：1007-7847(2008)01-0061-05
Preliminary Study on Gene Expression Profiling of Human Embryonic Stem Cells and Embryoid Bodies
注：本文中所涉及到的图表、注解、公式等内容请以PDF格式阅读原文
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