红腹锦鸡线粒体DNA控制区结构和遗传变异研究
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2011年3月1日
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黄族豪 廖信军 井冈山大学生命科学学院;
【摘要】红腹锦鸡(Chrysolophus pictus)是中国特有珍稀鸟类,仅见于中国中部和西部的山地,为国家二级重点保护动物.采用聚合酶链式反应和直接测序的方法测定了采自湖南新宁县和龙山县的28只红腹锦鸡线粒体DNA控制区序列.在获得的1 123 bp的碱基序列中,碱基含量为T 32.79%、C 26.07%、A 26.62%和G14.52%,共检测出20个多态性核苷酸变异位点,其中简约信息位点11个.对比其它已报导的雉类控制区结构,对红腹锦鸡控制区结构进行了分析,识别了其高变Ⅰ区、中间保守Ⅱ区和保守Ⅲ区,找到了与终止相关的序列TAS以及保守序列(F、E、D、C).28个样本共发现11种单倍型,其中单倍型hap1和hap2的比例很高.新宁种群的遗传多样性比龙山种群的高,两个种群存在基因流较频繁,未出现明显遗传分化.
【关键词】 红腹锦鸡 线粒体DNA 控制区 遗传变异
【基金】国家自然科学基金资助项目(30960051) 江西省自然科学基金资助项目(2009GZN0075) 江西省青年科学家(井冈之星)培养对象计划资助项目 江西省教育厅科技项目(GJJ11529)
【分类号】Q953
动物线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtD-NA)是共价闭合的环状双链DNA,具有母系遗传特性,进化速率非常快,约是单拷贝核DNA的5～10倍[1].mtDNA控制区(control region)也称为D环(displacement-loop region,D-loop),是非编码基因,所受进化压力较小,其遗传变异相比编码序列更大,是
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