滇龙胆GrHMA基因的克隆和原核表达(3)
选择GrHMA氨基酸序列,在NCBI中进行BLASTp分析,结果表明滇龙胆GrHMA蛋白属于HMA超家族(图4)。GrHMA氨基酸序列与NCBI中经比对后一致性较高的可可(Theobroma cacao)、拟南芥(Ara-bidopsis thaliana)、蓖麻(Ricinus communis)、蒺藜状苜蓿(Medicago truncatula)HMA氨基酸序列进行比对,结果表明GrHMA蛋白与可可TcHMA同源性最高(74%),其次是拟南芥AtHMA,同源性为70%,与蒺藜状苜蓿HMA蛋白的同源性较低(39%),见表1。
根据推测的氨基酸序列进行的系统发育分析,结果表明GrHMA与TcHMA在同一进化枝上,表明GrHMA与TcHMA蛋白的亲缘关系较近(图5)。GrHMA与NCBI中HMA已知序列进行多序列比对,结果表明滇龙胆GrHMA蛋白保守性较强,与已知序列存在较高的同源性(图6)。
利用ExPASy SignalP 4.0 Server在线软件(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)对GrHMA蛋白进行分析 ......
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