DNA条形码在主要滇产石斛鉴别中的应用(3)
44ITS序列对不同品种石斛的鉴定能力评价对于ITS片段，由于具有序列长度较短，易于扩增，对样本要求较低。在本实验中，其扩增和测序成功率均接近100%。根据实验数据分析，除了叠鞘石斛(D aurantiacum)的K2P种内遗传距离为006，大于种间遗传距离，其余各品种的种间遗传距离均大于种内遗传距离。使用Mega 50软件进行1000次自展计算，对14个石斛品种进行NJ树的构建，由图2可以看出，以密花石豆兰 (Bulbophyllum odoratissimum)为外类群[6]，基于ITS序列构建的NJ系统聚类树，不同的石斛品种基本上都聚在一起。同时barcoding gap分析显示，其种内与种间变异区分为两大部分，有明显的barcoding gap，其分布较高的遗传变异也可以明显区分。综合以上分析，ITS序列可以作为鉴别不同石斛物种的优选序列。
综上，本实验筛选了4个热点DNA条形码片段 ......
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