代谢组学在肝功能衰竭中的应用及研究进展
乙型肝炎,产物,1代谢组学的概念,研究层次,分类及整合,23小结
李莎莎,余祖江,阚全程本文文献检索策略:
计算机检索万方数据库、中国知网及PubMed等数据库,以“肝功能衰竭”“代谢组学”及“liver failure”“metabolomics”为检索词,参考国内相关文献写作层次,收集关于肝功能衰竭代谢组学方面的研究并记录;根据诊断、病变程度及病因3个方面进行分类,分析、总结其代谢组学研究方法及特点。
我国病毒性肝炎发病率高,且每年因肝病死亡的人数达50万以上。病毒性肝炎发展至肝功能衰竭后病死率极高,但肝功能衰竭的发病机制、诊断、治疗及预防仍是目前研究的难题。肝脏是人体内最重要的解毒器官,也是物质能量的代谢中心,对各种药物、毒物和体内的大多数代谢产物具有转化作用。肝脏病变进展会导致体内物质代谢转化系统发生相应转变,并对其内源性小分子化合物产生相应影响[1]。代谢组学从小分子物质的角度研究肝功能衰竭的相关过程,通过对代谢物及其转化途径的分析可以更好地了解肝功能衰竭相关病理过程,在肝病研究中具有重要意义。此外,对肝功能衰竭的代谢组学研究有助于发现具有诊断价值的特异性标志物[2],如乳酸、丙戊酸等,本文对以上内容进行了综述。
1 代谢组学的概念、研究层次、分类及整合
代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学之后一个新兴的后基因组学的研究领域,是系统生物学的重要组成部分[3]。代谢组学通过研究生物体血浆、尿液、组织液、细胞培养液中的内源性代谢产物,定性、定量地反映生物体在不同时间及环境下的功能状态;此外,生物体组织、器官也可以作为样本进行代谢组学研究[4]。
基于不同研究目的和研究对象,Fiehn等[5]将代谢组学分为4个研究层次:代谢物靶标分析、代谢谱分析、代谢物组及代谢指纹分析(对样本进行快速的定性)。目前,肝功能衰竭的代谢组学研究主要于代谢指纹分析层次上开展。
代谢组学研究的技术手段主要包括核磁共振(NMR)、气象色谱(GC)、液相色谱(LC)、质谱(MS)、毛细管电泳(CE)、红外光谱、紫外光谱等,目前应用最广泛的是NMR、GC-MS联用技术及LC-MS联用技术。由于代谢组学的研究对象是内源性小分子代谢产物(相对分子质量<1 000 Da)[6-7],如糖、脂质、胆汁酸、肉毒碱、氨基酸等,而种类繁多的内源性小分子代谢产物在体内分布范围较广,因此常需通过联合多种技术手段才能够分析出特殊条件下的各种代谢产物[8-9]。
代谢组学具有高通量性和大规模性,相对单一的研究样本、检测技术和数据处理方法需要进一步整合以满足代谢组学研究需求 ......
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