白假丝酵母菌最优化 RNA提取策略的探索
破壁,1材料与方法,2结果,3讨论
李赛男,祁文瑾白假丝酵母菌最优化RNA提取策略的探索
李赛男,祁文瑾
目的 探索白假丝酵母菌总RNA简单、快捷、高效的提取方法。方法 选取昆明医科大学第一附属医院妇产科门诊2011年7月—2013年3月有临床症状且阴道分泌物镜检阳性的外阴阴道假丝酵母菌病(VVC)患者的白假丝酵母菌40株,选用不同时间与温度组合下的4种溶壁酶(Lyticase)破壁方案(A方案:37℃、12 h,B方案:25℃、12 h,C方案:37℃、24 h,D方案:25℃、24 h)进行RNA提取,将所得RNA进行荧光定量PCR(qPCR)反应验证RNA的浓度及纯度,并进行管家基因18S rRNA的检测。结果 D方案提取获得的RNA浓度高于A、B、C方案(P<0.05);B方案提取获得的RNA浓度高于A、C方案(P<0.05);而A、C两方案提取获得的RNA浓度比较,差异无统计学意义 (P>0.05)。B、D方案获得的RNA纯度高于A、C方案 (P<0.05);但A、C方案获得的RNA纯度比较,差异无统计学意义(P>0.05);B方案提取获得的RNA纯度高于D方案(P<0.05)。A、B、C、D方案提取的RNA扩增产物Ct转化值比较,差异有统计学意义(P<0.05);其中B、D方案qPCR扩增产物Ct转化值高于A、C方案(P<0.05);但B、D方案及A、C方案之间的 qPCR扩增产物Ct转化值比较,差异无统计学意义(P>0.05)。管家基因18S rRNA的引物扩增出的产物片段大小为150 bp。结论 以Lyticase破壁提取白假丝酵母菌具有简单易行及RNA产量高、纯度好的优点,值得临床推广应用。
白假丝酵母菌;RNA;聚合酶链反应;溶壁酶
李赛男,祁文瑾.白假丝酵母菌最优化RNA提取策略的探索[J].中国全科医学,2015,18(2):176-179. [www.chinagp.net]
Li SN,Qi WJ.Strategy of optimizing RNA extraction from candida albicans[J].Chinese General Practice,2015,18 (2):176-179.
外阴阴道假丝酵母菌病 (vulvovaginal candidisis,VVC)是常见的外阴阴道感染性疾病,是由假丝酵母菌感染引起的阴道黏膜和/或外阴真菌感染。对假丝酵母菌分子生物学水平的研究常需提取其总 RNA,由于假丝酵母菌细胞壁主要是由几丁质组成,壁厚且坚硬,破壁一直是假丝酵母菌总RNA提取的关键步骤 ......
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