哈萨克族原发性高血压病患者全血DNA甲基化位点筛查及异常甲基化谱的构建
淑萍,1对象与方法,2结果,3讨论
由淑萍,从美丽,倪国华,詹怀峰,王红军,金 晶,马登娥,叶力夏提,赵志强,蒋 红,刘 涛·论著·
哈萨克族原发性高血压病患者全血DNA甲基化位点筛查及异常甲基化谱的构建
由淑萍1,从美丽2,倪国华3,詹怀峰4,王红军5,金 晶6,马登娥7,叶力夏提4,赵志强1,蒋 红1,刘 涛8*
目的 应用基因芯片技术筛选哈萨克族原发性高血压病(EH)患者异常DNA甲基化位点,初步构建哈萨克族EH异常甲基化谱,为深入研究哈萨克族EH的发生机制提供理论依据。方法 2014年6月—2015年10月,在新疆乌鲁木齐县随机抽取哈萨克族牧民或半农牧民3 042例为调研对象,从其中的1 487例EH患者中随机选取3例作为EH组,并选取年龄匹配的3例健康者作为对照组。采用Illumina Human Methylation 450K BeadChip芯片对两组受试者的全血进行全基因组DNA甲基化检测,筛选DNA异常甲基化位点,采用Gene Ontology(GO)富集分析和Pathway分析了解异常甲基化基因的功能。结果 EH组和对照组间存在427个差异甲基化位点,其中高甲基化位点148个,低甲基化位点279个;这些位点位于不同的染色体上,其中以1号和6号染色体最多,Y染色体未见差异甲基化位点;GO富集分析结果显示,差异甲基化基因主要参与糖蛋白生物合成与代谢、血管发育、脉管系统发展、胶原蛋白结合等生物学过程;Pathway分析结果显示,差异甲基化基因主要参与了硫酸软骨素生物合成、胰岛素信号通路、胞吞等。结论 发生EH时DNA甲基化状态发生改变,多条差异甲基化基因与EH相关通路有关,但本研究仅是哈萨克族EH全基因组甲基化谱的开端,异常甲基化基因作为发生EH的候选分子标志物,若要获得更全面、更精确的结果,还需要进一步扩大样本量进行分析及验证。
高血压;哈萨克族;DNA甲基化;基因芯片
由淑萍,从美丽,倪国华,等.哈萨克族原发性高血压病患者全血DNA甲基化位点筛查及异常甲基化谱的构建[J].中国全科医学,2017,20(6):678-683.[www.chinagp.net]
YOU S P,CONG M L,NI G H,et al.Blood screening for DNA methylation sites and construction of aberrant methylation profile in Kazak essential hypertensive patients[J].Chinese General Practice ......
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