应用基于色谱质谱联用技术的蛋白质组学鉴定筛选胃癌相关蛋白质
歧化酶,超氧化物,2结果,3讨论
刘 羽,李兆星,檀碧波,范立侨,赵 群,张 萌,徐志彬,李 勇*·方法学研究·
应用基于色谱质谱联用技术的蛋白质组学鉴定筛选胃癌相关蛋白质
刘 羽1,李兆星1,檀碧波1,范立侨1,赵 群1,张 萌2,徐志彬3,李 勇1*
目的 应用基于色谱质谱联用技术(LC-MS)的蛋白质组学鉴定筛选胃癌相关蛋白质,并初步探讨其功能。方法 选取2011年4月—2012年9月于河北医科大学第四医院确诊为胃腺癌并进行手术切除者16例为研究对象。术中取患者胃癌组织及癌旁正常组织,采用基于LC-MS的蛋白质组学鉴定筛选胃癌组织及癌旁正常组织中的差异蛋白质,并应用免疫组化染色法验证筛选出的差异蛋白质。结果 基于LC-MS的蛋白质组学鉴定结果显示,胃癌组织与癌旁正常组织均鉴定了3 000~4 000种蛋白质,其中12种蛋白质差异显著,将其与GO数据库进行对比,去除二级节点中归类为“细胞组分”的结构蛋白质,在“分子功能”和“代谢过程”这两个节点中找到了4种可能与胃癌有关的蛋白质,即谷胱甘肽巯基转移酶-π-1(GST-π-1)、铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)、丙酮酸激酶M2(PK-M2)、P120连环蛋白(P120-ctn)。免疫组化染色结果显示,胃癌组织中GST-π-1、PK-M2、P120-ctn阳性率大于癌旁正常组织,Cu/Zn-SOD阳性率小于癌旁正常组织(P1 材料与方法
1.1 研究材料
1.1.1 组织标本来源 选取2011年4月—2012年9月于河北医科大学第四医院确诊为胃腺癌并进行手术切除者16例为研究对象。其中男9例,女7例;年龄51~72岁,平均年龄(59.2±10.6)岁。纳入标准:(1)确诊为胃癌,手术切除肿瘤,病理为胃腺癌;(2)术前未接受过放化疗等治疗。排除标准:(1)术后复发或合并其他恶性肿瘤者;(2)长期应用激素或免疫抑制剂者;(3)不同意参加研究者。术中取患者胃癌组织及癌旁正常组织各1.0 cm×0.5 cm×1.0 cm。标本一式两份,一份置于-80 ℃保存用于蛋白质组学鉴定;另一份以中性甲醛固定,用于免疫组化检测。
1.1.2 主要试剂与仪器 胰蛋白酶(美国Promega公司),盐酸胍(美国Sigma公司),二硫苏糖醇(华美生物工程有限公司),碘乙酰胺(美国EMD Chemicals公司),乙腈(美国Thermo Fisher Scientific公司),所有抗体及免疫组化试剂盒(美国Santa Cruz公司),液质联用仪(LTQ XL型,美国Thermo Fisher Scientific公司) ......
您现在查看是摘要页,全文长 17028 字符。