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编号:901443
儿童青少年双相情感障碍相关基因的生物信息学分析
http://www.100md.com 2018年11月20日 中国全科医学 2018年第33期
外显子,变异,测序,1资料与方法,2结果,3讨论
     杨超,傅岳文,张莉,王艳,杨萍

    研究表明,儿童青少年双相情感障碍(PBD)是一种发生于儿童或青少年早期(18岁以前)的精神障碍性疾病[1]。PBD患者有极高的共患病概率,美国一项研究表明,95.5%的PBD Ⅰ型患者伴有超过3种其他精神障碍[2],且该类患者病程更加迁延,复发率高,预后较差。由于PBD病情复杂、症状易与儿童期其他障碍的症状重叠,PBD患者很难得到较好的临床诊断及早期干预治疗,严重影响其社会功能及生活质量,自杀率也难以得到有效控制[3]。为了更加明确地指导PBD的防治,需要从分子水平揭示其发病机制。基因芯片技术是一种能够高通量地获取生物信息的技术,其可分析疾病组织与正常组织之间的差异表达基因。故本研究利用既往报道证实与PBD相关的变异基因进行生物信息挖掘分析,探索与PBD相关的通路及通路核心基因,以期从分子水平揭示PBD的发病机制,为PBD的基础研究和临床治疗提供新思路。

    1 资料与方法

    1.1 研究时间 本研究时间为2018年2—7月。

    1.2 基因组数据收集 文献检索及数据分析流程图见图1。

    图1 文献检索及数据分析流程图Figure 1 Flow chart of literature retrieval and data analysis

    1.2.1 PBD相关基因研究数据检索 文献纳入标准:(1)文献研究对象为PBD患者;(2)提供变异或差异基因名称。文献排除标准:某种干预措施对PBD基因变化的影响研究。分别以“pediatric bipolar disorder sequencing”“youth bipolar disorder sequencing”为关键词,在PubMed检索2014年1月—2018年7月的文献,共获得32篇文献。挑选其中应用全外显子组测序或转录组测序研究且纳入的患者例数超过10例的数据集,经检索筛选共得到5套完整数据集,包含4套全外显子组测序研究[4-7]及1套转录组测序研究[8]。

    1.2.2 全外显子组测序数据 KATAOKA等[4]利用全外显子组测序技术,对比临床数据进行相关性挖掘分析,在71个基因中检测到可导致蛋白功能缺失的致病变异;RAO等[5]的研究利用全外显子靶向测序技术 ......

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