髓系KLF5基因缺失小鼠腹主动脉瘤形成的生物信息学分析
差异基因,1材料与方法,2结果,3讨论
常全,张娜娜,马冬腹主动脉瘤(AAA)是一种老年常见高死亡率的心血管系统疾病,目前临床上仍无有效治疗药物,发病机制仍不明确[1]。本课题组前期研究发现,KLF5基因在人和小鼠AAA组织中表达升高,并且小鼠髓系特异性敲除KLF5基因能够下调Myo9b表达,减少巨噬细胞的浸润并抑制小鼠AAA的形成,但是对于详细的KLF5基因调控炎症相关基因表达的网络分析仍需探讨[2]。因此,为了进一步验证髓系KLF5基因表达在炎症和AAA形成过程中的促炎作用,本实验系统分析了CaPO4诱导髓系KLF5基因表达缺失(LyKLF5-/-)小鼠和野生型(WT)小鼠AAA组织的mRNA表达谱,利用在线生物信息学网站对血管炎症及AAA形成相关的基因进行功能和网络分析,为寻找有效药物治疗AAA疾病提供新的分子靶点和实验依据。
1 材料与方法
1.1 实验动物 健康雄性的C57BL/6小鼠,SPF级,由河北医科大学实验动物中心提供。将其中KLF5-flox小鼠和LysM-cre小鼠杂交培育雄性髓系遗传性LyKLF5-/-小鼠3只,并与同笼WT C57BL/6小鼠3只,AAA模型构建后共同培养14 d。LyKLF5-/-小鼠和WT 6~8周龄雄性小鼠(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)均由本实验室繁殖提供。
1.2 研究时间 2015年1月—2016年1月进行小鼠培养及mRNA芯片筛查。2019年2—4月对差异基因进行生物信息学分析。
1.3 CaPO4诱导小鼠AAA模型[3]将LyKLF5-/-小鼠和WT小鼠进行持续麻醉,无菌条件下进行腹部手术,暴露腹主动脉血管,分离肾动脉分支至髂总动脉血管,先包裹浸有CaCl2的无纺布条,后换为浸有磷酸缓冲盐溶液(PBS)的无纺布条。取出棉条后用0.9%氯化钠溶液冲洗,缝合内膜,撒上青霉素粉末,再缝合腹部外膜。
造模成功标准:造模后腹主动脉最大直径(d2)/瘤旁血管直径(d1)≥2。所有小鼠造模成功,实验过程没有死亡。
本研究创新点:
(1)应用生物信息学发现髓系KLF5基因表达缺失小鼠抑制腹主动脉瘤(AAA)形成的炎症网络调控机制。(2)发现主要基因Bcas3、Hck表达上调和Retnla、Olig1、Tnfrsf11a表达下调参与炎症调控,为靶向治疗AAA提供新的分子靶点。
本研究不足:
本研究未进行临床研究,可能存在基因表达之间的相互影响,导致研究结果并不准确。
1.4 腹主动脉组织总RNA的提取及mRNA表达谱的检测 分离小鼠损伤腹主动脉 ......
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